MSTC|LTR|MaLR-HOMER865	chr1	613601	613792	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER871	chr1	617053	617168	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1360	chr1	942425	942512	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2119	chr1	1346374	1346558	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2636	chr1	1601300	1601630	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2638	chr1	1601927	1602000	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3514	chr1	2089489	2089624	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3516	chr1	2089940	2090002	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER6034	chr1	3829138	3829290	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER9819	chr1	7000286	7000321	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER9885	chr1	7067115	7067524	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER27564	chr1	16625028	16625055	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER27591	chr1	16641216	16641625	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER30326	chr1	18084812	18085226	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER32378	chr1	19075684	19075782	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER33869	chr1	19770025	19770480	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER40926	chr1	23021592	23021777	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER40928	chr1	23022088	23022329	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER43421	chr1	24101225	24101432	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER43423	chr1	24101604	24101782	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER51506	chr1	27480464	27480729	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER51508	chr1	27481047	27481112	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER52553	chr1	27946077	27946436	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER53792	chr1	28548979	28549146	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER54860	chr1	28970500	28970692	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER54862	chr1	28970997	28971185	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER56639	chr1	29705074	29705456	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER56641	chr1	29705755	29705800	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER58633	chr1	30554905	30555220	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER58635	chr1	30555517	30555596	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER62823	chr1	32226863	32227232	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER63150	chr1	32393376	32393708	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER63152	chr1	32394010	32394099	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER64936	chr1	33307176	33307566	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER65404	chr1	33545304	33545387	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER65408	chr1	33545681	33546012	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER70821	chr1	35848235	35848661	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER72351	chr1	36667689	36667892	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER72353	chr1	36668195	36668383	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER72619	chr1	36808158	36808600	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER72859	chr1	36944356	36944727	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER72861	chr1	36944960	36945001	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER73572	chr1	37355379	37355753	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER78166	chr1	39403799	39404215	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER79397	chr1	40085206	40085515	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER79412	chr1	40094014	40094416	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER80497	chr1	40687277	40687593	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER80499	chr1	40687908	40688135	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER81464	chr1	41220580	41220920	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER96124	chr1	48303138	48303313	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER96126	chr1	48303613	48303830	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER99672	chr1	50068968	50069191	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER99674	chr1	50069464	50069639	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER103256	chr1	51894750	51895152	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER107127	chr1	53944085	53944488	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER113335	chr1	56460969	56461375	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER118526	chr1	59007909	59008061	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER118527	chr1	59008074	59008204	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER127190	chr1	63317222	63317641	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER131499	chr1	65581768	65582111	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER139150	chr1	69675393	69675808	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER139152	chr1	69677317	69677718	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER139642	chr1	69932289	69932371	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER139644	chr1	69932507	69932852	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER142085	chr1	71157920	71157992	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER142087	chr1	71158296	71158671	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER142580	chr1	71464661	71465051	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER146672	chr1	73997126	73997493	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER149715	chr1	76022823	76023237	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER152012	chr1	77496113	77496476	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER153846	chr1	78605813	78606228	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER156926	chr1	80507079	80507148	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER156928	chr1	80507279	80507638	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER160299	chr1	82491724	82491973	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER160301	chr1	82492272	82492478	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER160303	chr1	82494154	82494265	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER160305	chr1	82494920	82494986	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER160307	chr1	82495588	82495811	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER168277	chr1	87736797	87737208	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER172456	chr1	90232908	90233278	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER172460	chr1	90235263	90235614	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER179073	chr1	94463131	94463559	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER184581	chr1	97400019	97400445	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER187714	chr1	99399247	99399675	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER189116	chr1	100273493	100273907	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER192502	chr1	102422300	102422753	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER194753	chr1	103591877	103592306	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER194808	chr1	103624512	103624579	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER194811	chr1	103626032	103626446	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER195170	chr1	103857534	103857902	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER195665	chr1	104159321	104159360	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER197206	chr1	105076891	105077294	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER197630	chr1	105324273	105324557	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER201043	chr1	107418668	107419074	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER202704	chr1	108436752	108437044	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER203909	chr1	109164176	109164501	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER203911	chr1	109166039	109166469	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER205249	chr1	109996451	109996683	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER205251	chr1	109996995	109997234	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER206026	chr1	110513757	110513799	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER206882	chr1	111093265	111093523	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER207066	chr1	111218485	111218593	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER207270	chr1	111349574	111349657	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER209426	chr1	112495897	112496225	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER209428	chr1	112496519	112496570	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER210246	chr1	113019737	113019993	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER210248	chr1	113020762	113020888	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER210353	chr1	113094114	113094478	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER215458	chr1	115986160	115986376	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER215462	chr1	115986765	115986775	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER220230	chr1	118594607	118594990	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER221702	chr1	119478594	119478998	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER224481	chr1	121097554	121097947	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER225159	chr1	121537339	121537685	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER230120	chr1	127092076	127092115	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER230971	chr1	127579374	127579550	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER230973	chr1	127580088	127580289	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER238962	chr1	132021606	132022025	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER239716	chr1	132386346	132386663	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER239721	chr1	132387300	132387367	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER246645	chr1	135818335	135818509	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER246646	chr1	135818531	135818561	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER246985	chr1	136060447	136060622	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER246986	chr1	136060788	136060870	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER246988	chr1	136061296	136061481	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER249266	chr1	137684654	137685052	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER249575	chr1	137893713	137894116	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER255398	chr1	141367575	141367885	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER256177	chr1	142098829	142099232	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER256436	chr1	142252592	142253008	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER256656	chr1	142383879	142384284	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER257460	chr1	142926748	142926992	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER257462	chr1	142927144	142927295	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER267338	chr1	148499595	148499671	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER267503	chr1	148615648	148616015	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER271126	chr1	150836340	150836767	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER272843	chr1	151973554	151973811	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER272845	chr1	151974166	151974214	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER273150	chr1	152150054	152150487	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER280575	chr1	157101799	157102209	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER282653	chr1	158169505	158169934	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER282808	chr1	158236207	158236626	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER283611	chr1	158648231	158648644	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER285725	chr1	159781510	159781907	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER286105	chr1	160014302	160014444	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER286107	chr1	160014834	160015108	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER288247	chr1	161317066	161317145	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER288250	chr1	161317487	161317859	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER288876	chr1	161691604	161691797	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER288878	chr1	161692107	161692368	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER289397	chr1	162037424	162037625	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER289399	chr1	162037903	162038147	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER291172	chr1	163209429	163209869	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER291530	chr1	163463693	163464092	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER292649	chr1	164128581	164128972	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER295775	chr1	165908827	165908884	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER302055	chr1	169247415	169247823	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER302755	chr1	169679334	169679682	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER302758	chr1	169679987	169680024	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER307026	chr1	172071965	172072396	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER307534	chr1	172415130	172415500	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER313666	chr1	176388334	176388685	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER313854	chr1	176493790	176493929	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER315481	chr1	177492138	177492493	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER318062	chr1	179093464	179093894	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER320474	chr1	180731814	180732237	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER320698	chr1	180852577	180852649	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER320700	chr1	180852731	180853084	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER321553	chr1	181369636	181370008	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER322599	chr1	181986211	181986637	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER322603	chr1	181988516	181988926	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER323566	chr1	182627620	182628039	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER323568	chr1	182629536	182629602	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER323570	chr1	182629939	182630064	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER324135	chr1	182985523	182985879	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER325810	chr1	184048938	184049361	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER326108	chr1	184224986	184225381	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER327301	chr1	185024829	185025005	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER331286	chr1	187325228	187325611	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER331287	chr1	187325673	187325724	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER332923	chr1	188249514	188249724	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER333251	chr1	188402607	188402659	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER333254	chr1	188402848	188403213	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER333303	chr1	188426695	188426853	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER333305	chr1	188427004	188427234	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER333307	chr1	188427912	188427950	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER335060	chr1	189549107	189549521	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER336891	chr1	190669676	190670066	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER342513	chr1	194055704	194056135	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER348702	chr1	197784973	197785355	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER348777	chr1	197836732	197837134	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER348854	chr1	197871801	197872242	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER351003	chr1	199166008	199166403	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER352779	chr1	200341261	200341669	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER353459	chr1	200811996	200812191	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER353606	chr1	200899084	200899510	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER354194	chr1	201255891	201256278	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER354196	chr1	201256569	201256610	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER354925	chr1	201665033	201665199	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER354928	chr1	201666481	201666897	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER355073	chr1	201761753	201762071	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER356981	chr1	203068052	203068428	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER358471	chr1	203833123	203833307	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER358473	chr1	203833526	203833638	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER358475	chr1	203833948	203834073	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER363734	chr1	207145921	207146326	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER365078	chr1	208206044	208206169	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER365079	chr1	208206230	208206451	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER366847	chr1	209671327	209671687	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER366927	chr1	209709170	209709478	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER367495	chr1	210020548	210020691	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER367499	chr1	210021266	210021318	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER368819	chr1	210684555	210684650	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER368823	chr1	210685597	210685882	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER371487	chr1	212300874	212300999	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER371489	chr1	212301179	212301229	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER371861	chr1	212469400	212469823	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER373076	chr1	213107780	213108205	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER378671	chr1	216264913	216265274	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER381453	chr1	217881001	217881371	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER381455	chr1	217881605	217881654	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER384968	chr1	220069376	220069545	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER385915	chr1	220589568	220589981	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER386770	chr1	220984553	220984941	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER387703	chr1	221472869	221473292	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER388973	chr1	222018458	222018808	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER388976	chr1	222019417	222019487	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER389136	chr1	222104333	222104734	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER389144	chr1	222108852	222109282	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER390567	chr1	222978666	222978725	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER390571	chr1	222981646	222982023	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER393094	chr1	224631919	224632143	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER393096	chr1	224632454	224632642	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER393189	chr1	224691769	224692199	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER393225	chr1	224724670	224725105	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER393778	chr1	225068002	225068413	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER395352	chr1	225900141	225900365	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER395682	chr1	226087462	226087526	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER395684	chr1	226087660	226087848	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER395687	chr1	226088185	226088374	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER395733	chr1	226126284	226126721	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER396042	chr1	226341549	226341760	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER396251	chr1	226457002	226457397	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER397451	chr1	227177204	227177631	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER398642	chr1	227803292	227803338	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER398897	chr1	227975088	227975147	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER398903	chr1	227978387	227978761	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER404958	chr2	4231923	4232327	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER406878	chr2	5454799	5454827	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER407593	chr2	5946850	5946916	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER409684	chr2	7387710	7388107	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER409693	chr2	7391208	7391247	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER410540	chr2	7892973	7893392	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER411076	chr2	8243059	8243132	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER411077	chr2	8243226	8243581	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER411092	chr2	8253855	8254300	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER411202	chr2	8323039	8323191	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER412641	chr2	9249074	9249451	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER414577	chr2	10636788	10636898	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER414758	chr2	10743486	10743915	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER414889	chr2	10829375	10829420	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER414891	chr2	10829734	10830100	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER416513	chr2	11959035	11959442	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER419488	chr2	14019432	14019828	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER419945	chr2	14316454	14316567	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER419947	chr2	14317857	14318277	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER421344	chr2	15182854	15183298	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER425125	chr2	17734775	17735191	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER426606	chr2	18795174	18795562	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER431968	chr2	22134660	22134942	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER432460	chr2	22431187	22431570	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER432680	chr2	22584184	22584402	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER435435	chr2	24403027	24403398	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER437434	chr2	25674937	25675149	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER437775	chr2	25897083	25897195	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER438167	chr2	26171121	26171526	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER438970	chr2	26685584	26685993	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER441149	chr2	28053266	28053622	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER442968	chr2	29237584	29237989	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER443778	chr2	29614081	29614479	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER444407	chr2	29996351	29996752	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER446868	chr2	31683006	31683437	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER448951	chr2	33022033	33022395	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER451899	chr2	34898547	34898951	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER452504	chr2	35314637	35315061	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER452899	chr2	35559285	35559697	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER455438	chr2	37346262	37346434	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER456118	chr2	37825316	37825699	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER460489	chr2	40605004	40605424	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER462245	chr2	41715963	41716096	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER462247	chr2	41717688	41718066	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER463363	chr2	42346437	42346542	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER464496	chr2	42997570	42997978	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER465125	chr2	43359086	43359454	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER465968	chr2	43851906	43852326	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER466043	chr2	43893029	43893404	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER466676	chr2	44286003	44286370	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER469412	chr2	45801404	45801822	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER469419	chr2	45804414	45804775	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER470253	chr2	46316971	46317423	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER470611	chr2	46544744	46545156	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER471557	chr2	47336672	47337096	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER476683	chr2	49896499	49896934	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER476790	chr2	49944108	49944445	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER476791	chr2	49944444	49944667	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER482156	chr2	52399752	52400163	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER485163	chr2	54153142	54153538	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER485678	chr2	54492893	54493252	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER485898	chr2	54618532	54618951	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER486456	chr2	55000916	55001344	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER489017	chr2	56483683	56484071	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER490965	chr2	57618038	57618498	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER493092	chr2	58865048	58865461	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER494888	chr2	60033096	60033510	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER496803	chr2	61200805	61201183	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER497355	chr2	61530032	61530439	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER498407	chr2	62174496	62174895	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER498630	chr2	62323445	62323863	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER501868	chr2	63919197	63919617	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER501900	chr2	63931255	63931645	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER508561	chr2	67725344	67725725	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER508571	chr2	67730058	67730497	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER509818	chr2	68492873	68493314	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER509986	chr2	68568807	68569224	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER513416	chr2	70723343	70723418	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER513418	chr2	70723721	70723920	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER513420	chr2	70723976	70724090	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER519030	chr2	73773337	73773746	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER521289	chr2	75076167	75076561	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER532634	chr2	81388504	81388929	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER533592	chr2	82072614	82072986	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER533896	chr2	82249162	82249592	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER548421	chr2	90197658	90198078	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER549758	chr2	90969911	90970217	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER549760	chr2	90970540	90970632	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER551044	chr2	91650813	91651057	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER551328	chr2	91797922	91798263	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER551330	chr2	91798558	91798621	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER551812	chr2	92055195	92055247	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER556949	chr2	94996849	94997240	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER558263	chr2	95836350	95836757	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER559051	chr2	96242653	96243079	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER560937	chr2	97322583	97322658	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER561021	chr2	97362899	97362987	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER561055	chr2	97388299	97388733	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER562226	chr2	98163577	98164002	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER562350	chr2	98225720	98226118	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER562442	chr2	98273133	98273525	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER565786	chr2	100179840	100180261	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER566010	chr2	100297828	100298233	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER569661	chr2	102170032	102170427	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER569727	chr2	102195285	102195702	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER569792	chr2	102223372	102223799	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER576240	chr2	105715268	105715311	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER577549	chr2	106501980	106502358	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER578825	chr2	107257346	107257409	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER578827	chr2	107257716	107257987	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER578945	chr2	107326351	107326532	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER578947	chr2	107326847	107326868	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER578949	chr2	107327181	107327373	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER579971	chr2	107864883	107865307	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER582048	chr2	109243426	109243861	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER582180	chr2	109324964	109325360	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER585243	chr2	111310650	111310691	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER585245	chr2	111311288	111311661	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER586577	chr2	112327474	112327904	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER586806	chr2	112478763	112479115	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER586808	chr2	112479395	112479490	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER587481	chr2	112910378	112910737	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER592669	chr2	116124233	116124622	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER595817	chr2	118058560	118058886	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER596081	chr2	118295965	118296040	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER596140	chr2	118335537	118335677	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER598111	chr2	119713360	119713721	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER602467	chr2	122650225	122650549	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER604284	chr2	123860861	123861280	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER607851	chr2	126270006	126270422	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER608311	chr2	126528521	126528807	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER610383	chr2	127773023	127773334	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER610951	chr2	128115643	128116054	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER618344	chr2	132912072	132912469	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER619275	chr2	133519354	133519783	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER619609	chr2	133770758	133771165	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER620260	chr2	134187154	134187519	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER620262	chr2	134188028	134188103	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER622483	chr2	135569575	135569948	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER623387	chr2	136127826	136128278	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER623391	chr2	136129572	136129832	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER623395	chr2	136130460	136130652	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER633903	chr2	142746884	142746970	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER633905	chr2	142747294	142747369	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER633907	chr2	142747674	142747858	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER633909	chr2	142748294	142748400	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER635208	chr2	143601342	143601752	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER635383	chr2	143705185	143705581	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER637334	chr2	145047971	145048402	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER639169	chr2	145927322	145927596	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER639513	chr2	146064263	146064650	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER640257	chr2	146481499	146481896	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER640320	chr2	146514061	146514435	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER641757	chr2	147416991	147417387	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER642299	chr2	147776119	147776536	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER642453	chr2	147889740	147890153	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER642639	chr2	148006376	148006795	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER645953	chr2	149798336	149798749	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER646273	chr2	150010445	150010871	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER647234	chr2	150675465	150675864	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER647383	chr2	150756336	150756406	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER647385	chr2	150756702	150757056	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER651253	chr2	152789289	152789711	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER655455	chr2	155359969	155360385	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER663032	chr2	159977792	159977894	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER664177	chr2	160712757	160713182	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER665990	chr2	161928266	161928529	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER667581	chr2	162825255	162825340	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER667769	chr2	162981114	162981203	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER672156	chr2	165928746	165929113	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER672158	chr2	165930903	165931264	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER672998	chr2	166447231	166447338	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER675510	chr2	168036348	168036748	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER675976	chr2	168306698	168307017	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER677982	chr2	169614016	169614438	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER680743	chr2	171200916	171201270	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER682856	chr2	172648848	172649232	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER683886	chr2	173332285	173332704	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER684763	chr2	173833067	173833492	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER685936	chr2	174506744	174506789	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER686626	chr2	174808316	174808722	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER688321	chr2	175553010	175553441	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER690744	chr2	176843693	176844101	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER692231	chr2	177796305	177796705	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER692514	chr2	177978530	177978948	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER692517	chr2	177979758	177980161	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER693137	chr2	178455434	178455799	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER693139	chr2	178456112	178456196	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER693572	chr2	178750468	178750876	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER694506	chr2	179266921	179267095	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER695054	chr2	179542305	179542724	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER695056	chr2	179544299	179544343	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER698401	chr2	181418545	181418960	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER701123	chr2	183028595	183028977	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER701629	chr2	183332401	183332660	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER702123	chr2	183605043	183605444	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER703141	chr2	184252029	184252391	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER703849	chr2	184689947	184690359	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER704070	chr2	184829290	184829643	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER705141	chr2	185445559	185446000	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER706403	chr2	186204861	186205219	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER707556	chr2	186794908	186795341	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER709255	chr2	187676946	187677175	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER709261	chr2	187677860	187678068	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER709400	chr2	187733633	187734037	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER713396	chr3	88249	88596	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER713593	chr3	204889	205231	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER714024	chr3	475433	475481	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER714836	chr3	1060121	1060514	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER714894	chr3	1086072	1086238	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER714895	chr3	1086392	1086575	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER714896	chr3	1086576	1086691	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER715011	chr3	1160591	1160972	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER718208	chr3	3553876	3554247	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER718732	chr3	3855358	3855441	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER718734	chr3	3856592	3856674	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER719420	chr3	4314989	4315306	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER721819	chr3	5846454	5846869	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER721824	chr3	5849265	5849654	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER721956	chr3	5927290	5927658	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER722704	chr3	6389205	6389403	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER722711	chr3	6390424	6390502	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER722999	chr3	6642564	6642742	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER723001	chr3	6643416	6643548	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER724562	chr3	7489985	7490386	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER724801	chr3	7622155	7622557	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER725787	chr3	8294643	8295026	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER726382	chr3	8686526	8686927	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER727938	chr3	9603001	9603048	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER727940	chr3	9603375	9603398	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER727942	chr3	9603720	9603847	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER727944	chr3	9604166	9604223	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER727947	chr3	9604818	9604895	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER728148	chr3	9699920	9700291	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER728493	chr3	9922796	9922839	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER728499	chr3	9923780	9923857	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER729483	chr3	10403953	10404356	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER729624	chr3	10457023	10457448	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER729685	chr3	10478961	10479285	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER729687	chr3	10479557	10479599	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER730848	chr3	11177443	11177878	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER734058	chr3	13157363	13157577	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER734060	chr3	13157866	13158070	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER734551	chr3	13379680	13379796	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER736563	chr3	14499519	14499925	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER738679	chr3	15530993	15531085	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER738680	chr3	15531688	15531745	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER739067	chr3	15837784	15838117	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER740168	chr3	16620132	16620504	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER747409	chr3	21006412	21006843	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER748319	chr3	21572644	21572687	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER748327	chr3	21574722	21575101	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER749263	chr3	22137104	22137256	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER749536	chr3	22312790	22312807	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER749538	chr3	22312887	22313287	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER750035	chr3	22594685	22595105	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER751149	chr3	23270986	23271409	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER751627	chr3	23587625	23587979	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER751697	chr3	23635663	23636080	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER751709	chr3	23643820	23644237	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER752576	chr3	24155250	24155655	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER752578	chr3	24155951	24155986	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER756406	chr3	26586443	26586889	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER756689	chr3	26750129	26750568	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER757235	chr3	27164059	27164221	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER758567	chr3	28158393	28158794	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER763108	chr3	31190815	31191235	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER764427	chr3	32089935	32090347	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER772485	chr3	41770417	41770849	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER772522	chr3	41795228	41795613	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER773854	chr3	42531101	42531231	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER774750	chr3	42945377	42945706	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER774887	chr3	43000417	43000487	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER775388	chr3	43239492	43239562	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER776422	chr3	43742134	43742558	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER776424	chr3	43742837	43742900	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER777034	chr3	44259642	44259945	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER777036	chr3	44260234	44260307	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER777038	chr3	44261295	44261326	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER778478	chr3	44928807	44929176	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER780245	chr3	45792803	45793228	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER784864	chr3	48291505	48291710	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER784867	chr3	48292048	48292346	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER794383	chr3	52622833	52623175	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER794384	chr3	52623176	52623220	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER794387	chr3	52623781	52623848	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER794404	chr3	52630463	52630829	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER794406	chr3	52631108	52631202	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER795038	chr3	52900693	52900759	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER795040	chr3	52901229	52901600	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER795590	chr3	53159484	53159928	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER796826	chr3	53713777	53714197	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER799524	chr3	54858230	54858594	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER800494	chr3	55456614	55456669	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER800496	chr3	55456969	55457246	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER801622	chr3	56140825	56140854	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER801624	chr3	56140914	56140932	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER801626	chr3	56141221	56141380	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER801628	chr3	56141812	56142055	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER801860	chr3	56239502	56239856	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER801862	chr3	56240165	56240226	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER815106	chr3	70969991	70970325	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER815502	chr3	71291222	71291329	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER815573	chr3	71337112	71337472	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER817457	chr3	72610478	72610901	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER817960	chr3	72957844	72958283	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER818707	chr3	73392746	73393155	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER820823	chr3	74811938	74812339	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER823514	chr3	76690828	76691246	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER824157	chr3	77113644	77114076	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER825353	chr3	77955534	77955580	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER827042	chr3	79050494	79050861	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER827913	chr3	79686762	79687158	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER828811	chr3	80295596	80295852	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER830247	chr3	81230888	81230935	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER833740	chr3	83093286	83093713	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER833980	chr3	83227561	83227955	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER835178	chr3	84032144	84032596	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER835207	chr3	84051811	84051943	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER839396	chr3	86561889	86562026	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER839397	chr3	86562034	86562185	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER839399	chr3	86562476	86562518	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER839784	chr3	86743668	86743786	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER844991	chr3	90091588	90091921	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER845989	chr3	90631428	90631857	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER853851	chr3	95398981	95399392	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER854580	chr3	95830504	95830773	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER858312	chr3	98135452	98135788	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER861292	chr3	100013396	100013546	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER861309	chr3	100021988	100022033	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER862457	chr3	100722157	100722592	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER864097	chr3	101725573	101725890	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER864973	chr3	102238351	102238444	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER872188	chr3	106682440	106682544	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER872189	chr3	106682567	106682613	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER872347	chr3	106794975	106795149	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER873370	chr3	107599556	107599935	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER874894	chr3	108596842	108597266	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER875479	chr3	108982420	108982841	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER876181	chr3	109418194	109418535	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER881106	chr3	112755333	112755696	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER882410	chr3	113560215	113560603	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER883483	chr3	114277682	114278101	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER889304	chr3	118233177	118233241	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER889306	chr3	118233492	118233846	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER890690	chr3	119158456	119158877	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER890751	chr3	119222019	119222370	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER891624	chr3	119763325	119763738	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER892448	chr3	120226951	120227016	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER892450	chr3	120227326	120227695	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER895902	chr3	122419974	122420028	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER900374	chr3	125362908	125363311	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER901588	chr3	126215525	126215894	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER901694	chr3	126286378	126286742	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER905944	chr3	129188203	129188441	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER906248	chr3	129357810	129358178	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER907853	chr3	130406739	130407102	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER908660	chr3	130956178	130956580	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER909334	chr3	131363531	131363877	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER919943	chr3	138413440	138413824	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER919945	chr3	138414131	138414210	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER923009	chr3	140247351	140247763	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER923093	chr3	140306717	140307112	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER923567	chr3	140567825	140568218	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER926214	chr3	142281083	142281118	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER926216	chr3	142281194	142281522	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER934315	chr3	146955618	146955978	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER934321	chr3	146957355	146957791	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER936271	chr3	148254623	148254923	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER936632	chr3	148497838	148498197	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER938594	chr3	149745377	149745391	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER938632	chr3	149768061	149768413	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER939116	chr3	150070663	150071058	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER942322	chr3	152219245	152219662	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER942966	chr3	152654244	152654635	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER943092	chr3	152731708	152732007	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER944104	chr3	153407916	153408329	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER945544	chr3	154313436	154313562	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER948961	chr3	156509952	156510337	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER948965	chr3	156511577	156511843	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER949374	chr3	156798491	156798891	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER949942	chr3	157166854	157167265	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER955516	chr3	160800255	160800660	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER955518	chr3	160802224	160802532	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER955520	chr3	160802804	160802872	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER958217	chr3	162491854	162491944	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER958232	chr3	162499147	162499466	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER961209	chr3	164512154	164512542	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER961219	chr3	164516230	164516650	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER962360	chr3	165327948	165328001	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER963149	chr3	165835080	165835193	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER963215	chr3	165876033	165876456	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER966269	chr3	167325491	167325565	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER968449	chr3	168456652	168457076	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER969899	chr3	169182008	169182336	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER971049	chr3	170011292	170011698	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER971737	chr3	170450507	170450692	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER971739	chr3	170450993	170451216	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER972659	chr3	171031444	171031539	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER972744	chr3	171092165	171092414	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER976508	chr3	173314086	173314500	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER977235	chr3	173717734	173718149	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER978704	chr3	174636947	174637236	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER980641	chr3	175807635	175807812	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER983896	chr3	177346529	177346656	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER983897	chr3	177346652	177346814	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER984212	chr3	177533714	177534093	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER988663	chr3	180094184	180094594	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER997015	chr3	185525702	185526120	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER997127	chr3	185591265	185591466	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER997131	chr3	185592102	185592248	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1005297	chr3	190210189	190210427	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1009780	chr3	193627086	193627491	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1009977	chr3	193777454	193777499	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1010958	chr3	194343839	194344186	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1012999	chr3	196156964	196157320	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1013058	chr3	196207809	196208187	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1013775	chr4	309492	309872	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1014698	chr4	994118	994506	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1018813	chr4	3688136	3688557	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1019669	chr4	4129898	4130152	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1020849	chr4	4785859	4786247	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1021211	chr4	5006328	5006585	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1021213	chr4	5006873	5007019	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1023792	chr4	6698213	6698514	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1023794	chr4	6698826	6698922	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1025151	chr4	7382554	7382686	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1025153	chr4	7382974	7383070	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1025453	chr4	7559545	7559790	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1025455	chr4	7560096	7560304	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1025488	chr4	7581088	7581514	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1025903	chr4	7867745	7868159	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1029688	chr4	10273683	10274102	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1033198	chr4	12244029	12244441	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1036181	chr4	13955127	13955168	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1036183	chr4	13955471	13955852	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1037300	chr4	14621664	14622088	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1037478	chr4	14729139	14729248	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1037479	chr4	14729239	14729317	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1037481	chr4	14729623	14729671	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1037812	chr4	14903851	14903945	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1037814	chr4	14904242	14904593	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1049063	chr4	21277475	21277914	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1049155	chr4	21323115	21323427	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1049159	chr4	21324119	21324190	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1050730	chr4	22204539	22204944	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1051648	chr4	22854189	22854621	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1055088	chr4	24963563	24963985	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1055847	chr4	25357359	25357664	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1055849	chr4	25357722	25357803	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1056947	chr4	26032039	26032260	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1058335	chr4	26829931	26830312	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1058337	chr4	26830618	26830670	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1063934	chr4	29924757	29925074	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1067451	chr4	31993071	31993413	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1067453	chr4	31993713	31993780	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1067984	chr4	32420401	32420469	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1067986	chr4	32420786	32421120	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1068059	chr4	32466576	32466973	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1068061	chr4	32468618	32469013	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1069809	chr4	33627380	33627754	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1074059	chr4	35612945	35613136	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1076282	chr4	36627604	36627778	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1080930	chr4	39078119	39078317	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1080934	chr4	39079529	39079753	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1082206	chr4	39866081	39866467	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1083099	chr4	40423489	40423882	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1086883	chr4	42376021	42376423	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1097849	chr4	48884261	48884311	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1099906	chr4	50268209	50268597	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1102309	chr4	51878655	51878709	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1102310	chr4	51878708	51879046	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1102314	chr4	51881076	51881231	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1105275	chr4	53575254	53575446	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1107163	chr4	54873237	54873657	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1107166	chr4	54875347	54875663	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1108531	chr4	55834209	55834633	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1110578	chr4	57145371	57145792	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1111503	chr4	57774102	57774496	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1115843	chr4	60639164	60639203	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1117328	chr4	61647451	61647611	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1117881	chr4	61958104	61958478	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1119807	chr4	63177507	63177772	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1119809	chr4	63178074	63178253	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1120401	chr4	63555182	63555634	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1120967	chr4	63915340	63915757	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1121684	chr4	64365074	64365514	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1125469	chr4	66935067	66935495	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1125473	chr4	66937585	66937931	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1125475	chr4	66938243	66938308	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1129216	chr4	69421872	69422280	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1131221	chr4	70456971	70457205	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1131222	chr4	70457208	70457249	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1131224	chr4	70458372	70458634	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1131225	chr4	70458632	70458676	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1131227	chr4	70459068	70459258	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1132187	chr4	71144782	71145158	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1132954	chr4	71692970	71693368	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1136156	chr4	73730480	73730909	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1145655	chr4	79916921	79917311	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1146851	chr4	80740713	80740801	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1146855	chr4	80741580	80741904	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1147372	chr4	81155762	81156128	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1147453	chr4	81228403	81228535	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1148502	chr4	81846584	81846866	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1148504	chr4	81847259	81847370	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1148506	chr4	81847684	81847736	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1148884	chr4	82147623	82147688	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1148887	chr4	82148104	82148450	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1150607	chr4	83290832	83291223	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1150666	chr4	83323011	83323106	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1150668	chr4	83323416	83323515	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1150670	chr4	83323684	83323912	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1155320	chr4	85908430	85908849	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1156091	chr4	86384326	86384473	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1157631	chr4	87472334	87472463	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1160269	chr4	89350179	89350592	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1163333	chr4	91357280	91357673	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1170036	chr4	95788981	95789372	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1174451	chr4	98733832	98734002	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1174519	chr4	98780281	98780668	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1175542	chr4	99408980	99409135	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1176920	chr4	100404844	100405219	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1177189	chr4	100575184	100575580	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1177293	chr4	100636050	100636363	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1177298	chr4	100638760	100639174	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1178868	chr4	101592039	101592454	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1180258	chr4	102496310	102496732	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1180625	chr4	102719635	102719986	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1182587	chr4	103689098	103689179	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1182589	chr4	103689216	103689545	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1183881	chr4	104332717	104332859	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1183883	chr4	104332980	104333064	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1184328	chr4	104552813	104553171	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1184670	chr4	104722443	104722482	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1184673	chr4	104723083	104723132	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1185678	chr4	105309878	105309957	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1185680	chr4	105310266	105310571	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1186752	chr4	106117136	106117496	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1189888	chr4	108084095	108084503	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1191340	chr4	108826833	108826969	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1193806	chr4	110367549	110367686	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1193809	chr4	110368261	110368454	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1194743	chr4	110994007	110994420	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1204799	chr4	116827527	116827901	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1205404	chr4	117248106	117248445	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1208840	chr4	119613788	119614218	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1209697	chr4	120157853	120158242	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1212778	chr4	122158337	122158758	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1213082	chr4	122341560	122341980	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1213084	chr4	122342300	122342350	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1214626	chr4	123297544	123297626	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1215727	chr4	124058556	124058911	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1218136	chr4	125442138	125442553	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1220140	chr4	126684256	126684677	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1220861	chr4	127064359	127064710	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1221867	chr4	127667954	127668342	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1222888	chr4	128346930	128347181	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1222890	chr4	128347524	128347692	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1226758	chr4	130650299	130650430	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1226763	chr4	130653120	130653502	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1228649	chr4	131910280	131910676	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1233773	chr4	135075287	135075705	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1235702	chr4	136369496	136369578	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1235705	chr4	136369884	136370251	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1236034	chr4	136577836	136578218	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1237388	chr4	137584663	137585088	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1238502	chr4	138349392	138349837	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1245672	chr4	142970423	142970569	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1246978	chr4	143817406	143817772	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1248973	chr4	145133564	145133954	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1250280	chr4	145998878	145999215	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1250868	chr4	146389050	146389499	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1252433	chr4	147369116	147369327	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1252720	chr4	147559394	147559808	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1253546	chr4	148130584	148130951	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1253851	chr4	148358566	148358935	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1258372	chr4	151364658	151364903	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1263558	chr4	154263220	154263284	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1263560	chr4	154263909	154264269	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1264057	chr4	154547089	154547139	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1264058	chr4	154547369	154547645	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1265791	chr4	155547561	155547627	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1265792	chr4	155547964	155547998	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1265794	chr4	155548294	155548654	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1266591	chr4	155937080	155937473	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1266595	chr4	155939347	155939777	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1269976	chr4	158239970	158240096	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1272966	chr4	160336522	160336895	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1278371	chr4	164468458	164468892	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1283194	chr5	710993	711335	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1283196	chr5	711844	711867	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1287296	chr5	2988174	2988583	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1289363	chr5	4014856	4015285	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1290251	chr5	4435056	4435286	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1290253	chr5	4435404	4435458	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1290257	chr5	4436982	4437365	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1290259	chr5	4437483	4437537	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1290839	chr5	4708033	4708139	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1290841	chr5	4708174	4708428	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1291550	chr5	5284561	5284950	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1291841	chr5	5444027	5444222	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1295551	chr5	7473756	7474102	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1297067	chr5	8304725	8305134	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1297631	chr5	8631692	8632062	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1300943	chr5	10445295	10445704	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1301228	chr5	10585935	10586369	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1302557	chr5	11323923	11324288	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1306052	chr5	13180714	13181135	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1306856	chr5	13613480	13613855	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1306882	chr5	13628443	13628697	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1308885	chr5	14749454	14749794	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1309132	chr5	14882834	14883245	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1312018	chr5	16624849	16625160	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1312352	chr5	16815871	16816293	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1314433	chr5	18028057	18028210	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1318887	chr5	20464475	20464571	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1318889	chr5	20464881	20465207	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1319351	chr5	20684213	20684571	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1321850	chr5	21999635	21999996	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1321858	chr5	22002484	22002908	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1322130	chr5	22172948	22173349	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1323695	chr5	23176921	23177094	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1328134	chr5	25935906	25936327	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1329521	chr5	26775530	26775634	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1330742	chr5	27542671	27543076	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1330777	chr5	27565316	27565512	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1331455	chr5	28009163	28009563	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1334430	chr5	29824147	29824575	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1337005	chr5	31495999	31496147	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1337007	chr5	31496462	31496686	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1337009	chr5	31496874	31496960	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1338081	chr5	32165756	32166193	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1338560	chr5	32501259	32501400	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1340046	chr5	33331861	33331913	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1340048	chr5	33332230	33332618	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1340102	chr5	33357585	33358018	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1341636	chr5	34149723	34150144	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1345554	chr5	35971428	35971820	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1345691	chr5	36040482	36040852	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1346468	chr5	36420523	36420944	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1349518	chr5	38319063	38319466	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1350076	chr5	38685451	38685599	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1350089	chr5	38692947	38693026	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1350493	chr5	38926821	38926860	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1357057	chr5	43056360	43056764	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1358734	chr5	44052753	44052938	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1359700	chr5	44611924	44612308	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1362712	chr5	46392025	46392339	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1362714	chr5	46392651	46392716	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1363031	chr5	46531884	46532262	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1363042	chr5	46535605	46535906	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1363047	chr5	46537648	46537795	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1367640	chr5	49369392	49369796	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1370457	chr5	51178708	51179121	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1373443	chr5	53088916	53089317	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1377978	chr5	55926129	55926494	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1377980	chr5	55926791	55926831	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1378956	chr5	56525416	56525839	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1379142	chr5	56631781	56631949	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1395364	chr5	67097744	67098155	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1395441	chr5	67146302	67146666	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1397113	chr5	68213960	68214400	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1397705	chr5	68605200	68605614	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1399811	chr5	69978871	69979200	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1399815	chr5	69980006	69980110	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1402981	chr5	72024515	72024631	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1402982	chr5	72024621	72024727	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1407801	chr5	74527733	74528118	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1417813	chr5	80924103	80924194	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1418748	chr5	81399564	81400009	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1419507	chr5	81870885	81871087	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1420435	chr5	82415032	82415333	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1422853	chr5	83966280	83966644	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1423824	chr5	84672357	84672696	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1427361	chr5	87022360	87022727	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1432064	chr5	90074750	90075162	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1432343	chr5	90278508	90278937	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1437032	chr5	93198093	93198513	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1438059	chr5	93899669	93900090	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1438122	chr5	93944884	93944935	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1438124	chr5	93945255	93945546	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1440358	chr5	95431969	95432032	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1440361	chr5	95433671	95434075	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1446471	chr5	99489277	99489653	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1446640	chr5	99724912	99725070	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1447200	chr5	100101251	100101362	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1447204	chr5	100101877	100102212	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1452851	chr5	103623888	103624264	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1458608	chr5	107321798	107322159	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1460121	chr5	108375458	108375888	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1460123	chr5	108377518	108377946	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1461641	chr5	109290741	109291104	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1462217	chr5	109655020	109655096	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1463243	chr5	110303663	110304062	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1467927	chr5	113325133	113325506	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1468117	chr5	113475098	113475498	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1469029	chr5	114101434	114101839	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1469491	chr5	114368851	114369244	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1469634	chr5	114455674	114455850	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1469765	chr5	114544078	114544467	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1470368	chr5	114960874	114961297	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1470745	chr5	115170921	115171242	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1470999	chr5	115315497	115315652	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1474957	chr5	117945308	117945756	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1477792	chr5	119852321	119852703	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1479312	chr5	120652789	120653120	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1479313	chr5	120653133	120653182	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1482138	chr5	122444130	122444491	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1483076	chr5	123010697	123011066	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1485377	chr5	124362559	124362970	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1486362	chr5	125055367	125055792	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1489857	chr5	127332849	127333071	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1490353	chr5	127648886	127649293	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1491897	chr5	128704642	128705052	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1492207	chr5	128895662	128896062	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1493058	chr5	129477301	129477728	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1494076	chr5	130131155	130131222	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1494078	chr5	130131530	130131875	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1502398	chr5	135336341	135336747	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1503820	chr5	136234477	136234885	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1504554	chr5	136748908	136749408	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1508778	chr5	139623911	139624290	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1509087	chr5	139797525	139797938	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1509338	chr5	139915044	139915098	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1509341	chr5	139915461	139915612	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1509346	chr5	139917939	139918049	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1509599	chr5	140052971	140053144	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1509601	chr5	140053435	140053544	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1511134	chr5	141119264	141119315	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1511505	chr5	141389337	141389733	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1511538	chr5	141418756	141419163	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1515965	chr5	144163015	144163380	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1516270	chr5	144344886	144345301	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1519370	chr5	146190440	146190746	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1519663	chr5	146405269	146405699	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1521139	chr5	147347115	147347198	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1521358	chr5	147493161	147493559	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1521360	chr5	147493595	147493648	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1522868	chr5	148449260	148449659	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1523008	chr5	148533270	148533699	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1523153	chr5	148633834	148634241	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1524047	chr5	149223533	149223640	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1525427	chr5	150150917	150151358	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1526245	chr5	150691545	150691952	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1528185	chr5	151816660	151816710	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1535561	chr5	156666645	156667047	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1535563	chr5	156668642	156669059	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1538502	chr5	158398821	158398914	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1538510	chr5	158399892	158400148	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1539604	chr5	159099535	159099968	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1544234	chr5	161970731	161971023	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1544236	chr5	161971583	161971711	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1544245	chr5	161974725	161975161	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1546102	chr5	163178254	163178629	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1546563	chr5	163557014	163557346	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1546566	chr5	163557539	163557618	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1546641	chr5	163598534	163598958	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1548920	chr5	165131395	165131459	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1548921	chr5	165131672	165131960	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1550828	chr5	166427751	166428185	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1552773	chr5	167677881	167678202	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1553540	chr5	168157142	168157593	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1557216	chr5	170496779	170497097	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1557542	chr5	170690174	170690561	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1559140	chr5	171663338	171663749	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1559337	chr5	171789252	171789673	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1560718	chr5	172755744	172756172	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1566264	chr5	176535161	176535577	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1573332	chr5	180961524	180961894	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1573925	chr5	181419300	181419747	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1574026	chr5	181480391	181480505	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1575532	chr6	641207	641252	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1576430	chr6	1441853	1441979	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1577722	chr6	2763886	2764298	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1578096	chr6	3074611	3074684	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1578098	chr6	3074984	3075033	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1580852	chr6	5332397	5332475	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1580854	chr6	5332798	5333042	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1581680	chr6	5931950	5931965	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1582441	chr6	6461371	6461772	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1582745	chr6	6681924	6682307	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1584236	chr6	7850594	7850646	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1584237	chr6	7850647	7850852	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1584270	chr6	7869193	7869598	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1584272	chr6	7871344	7871767	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1587256	chr6	10064840	10065218	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1587619	chr6	10251413	10251808	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1589955	chr6	11803688	11804093	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1590453	chr6	12128419	12128841	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1591032	chr6	12491644	12492048	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1591475	chr6	12764332	12764710	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1592680	chr6	13551834	13552034	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1592892	chr6	13685635	13686066	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1595391	chr6	15322562	15322982	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1595945	chr6	15694150	15694580	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1595968	chr6	15704931	15705347	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1601621	chr6	19014409	19014454	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1607655	chr6	22762185	22762567	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1614681	chr6	26990143	26990393	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1614683	chr6	26990757	26990902	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1614694	chr6	26998717	26998759	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1614696	chr6	26999065	26999277	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1615844	chr6	27692715	27693103	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1616008	chr6	27799220	27799579	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1616223	chr6	27932287	27932636	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1619219	chr6	29774448	29774879	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1621461	chr6	31291038	31291442	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1621500	chr6	31321965	31322145	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1621502	chr6	31322477	31322671	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1623275	chr6	32277582	32277784	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1624913	chr6	33136253	33136343	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1626952	chr6	34353722	34354129	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1626969	chr6	34361178	34361568	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1628394	chr6	35220101	35220515	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1630559	chr6	36618618	36619017	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1630597	chr6	36637688	36637833	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1634566	chr6	38867022	38867404	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1635758	chr6	39606720	39607151	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1636419	chr6	40052104	40052218	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1636736	chr6	40287951	40288351	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1636742	chr6	40291948	40292306	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1636744	chr6	40292333	40292391	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1639455	chr6	42058798	42058980	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1640522	chr6	42797904	42798123	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1640542	chr6	42809047	42809246	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1641112	chr6	43120735	43121142	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1642779	chr6	44322616	44322979	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1642934	chr6	44451972	44452376	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1643190	chr6	44648538	44648956	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1644379	chr6	45412237	45412478	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1644975	chr6	45879610	45879658	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1644978	chr6	45885429	45885721	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1647110	chr6	48899070	48899126	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1651281	chr6	51736847	51736899	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1651283	chr6	51737211	51737245	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1651285	chr6	51737385	51737650	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1651289	chr6	51738322	51738389	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1652488	chr6	52470997	52471417	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1654734	chr6	53699448	53699841	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1654736	chr6	53700143	53700186	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1654987	chr6	53832893	53833275	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1655775	chr6	54334410	54334478	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1657033	chr6	55013167	55013534	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1658575	chr6	56104256	56104598	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1659381	chr6	56602833	56602912	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1660880	chr6	57604590	57604919	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1660882	chr6	57605225	57605278	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1662240	chr6	58521098	58521353	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1663371	chr6	59189098	59189509	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1667111	chr6	61607705	61608105	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1669921	chr6	63375413	63375547	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1669923	chr6	63375860	63376153	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1670395	chr6	63619571	63619978	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1678903	chr6	68460104	68460493	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1679661	chr6	68931572	68931720	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1679662	chr6	68931742	68931892	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1679669	chr6	68940604	68940750	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1680037	chr6	69152658	69152703	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1680039	chr6	69152995	69153354	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1681314	chr6	69891326	69891731	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1681683	chr6	70166101	70166519	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1682228	chr6	70572500	70572903	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1682430	chr6	70694598	70695013	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1683491	chr6	71277125	71277471	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1683493	chr6	71277711	71277800	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1686953	chr6	73260013	73260402	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1691039	chr6	75762243	75762621	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1693151	chr6	76801974	76802273	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1693573	chr6	77012064	77012433	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1693575	chr6	77013026	77013172	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1697452	chr6	79455576	79455970	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1697458	chr6	79459947	79460107	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1698166	chr6	79989878	79989954	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1698167	chr6	79991010	79991353	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1699046	chr6	80603898	80604302	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1700967	chr6	81861057	81861489	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1701448	chr6	82161263	82161687	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1701984	chr6	82516315	82516707	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1702052	chr6	82558402	82558772	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1703656	chr6	83564291	83564667	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1707117	chr6	86059720	86059858	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1709710	chr6	87686215	87686371	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1710935	chr6	88531077	88531432	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1711674	chr6	89036771	89036863	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1711676	chr6	89038474	89038516	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1711681	chr6	89044296	89044665	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1714052	chr6	90799424	90799618	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1714054	chr6	90799915	90800159	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1719910	chr6	94714012	94714104	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1719912	chr6	94714386	94714659	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1719919	chr6	94718923	94719013	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1720190	chr6	94900142	94900497	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1720833	chr6	95305829	95306256	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1722223	chr6	96321046	96321469	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1722694	chr6	96607267	96607433	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1723297	chr6	96984368	96984785	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1725015	chr6	98092773	98092874	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1725017	chr6	98096640	98096882	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1725871	chr6	98645227	98645474	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1735774	chr6	105245621	105245659	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1738817	chr6	107329164	107329576	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1738914	chr6	107401414	107401826	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1739579	chr6	107855731	107856074	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1742273	chr6	109537439	109537551	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1742690	chr6	109810462	109810725	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1742692	chr6	109812364	109812754	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1745342	chr6	111656155	111656528	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1746027	chr6	112084115	112084535	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1748749	chr6	113836868	113837307	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1752029	chr6	115985427	115985862	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1755074	chr6	118072118	118072150	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1755785	chr6	118572026	118572078	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1756416	chr6	119030302	119030722	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1756495	chr6	119069401	119069542	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1759737	chr6	121184062	121184488	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1762731	chr6	123140394	123140447	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1762735	chr6	123141536	123141590	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1763406	chr6	123583876	123584247	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1764907	chr6	124633203	124633631	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1768274	chr6	127026181	127026395	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1768276	chr6	127026661	127026875	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1770664	chr6	128341348	128341719	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1770667	chr6	128342058	128342133	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1779395	chr6	133505101	133505490	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1780408	chr6	134180513	134180569	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1791208	chr6	139805176	139805595	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1791403	chr6	139909939	139910037	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1795017	chr6	142112083	142112510	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1796865	chr6	143023179	143023554	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1799698	chr6	144588105	144588167	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1801116	chr6	145446141	145446525	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1801118	chr6	145448223	145448555	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1808534	chr6	148963985	148964394	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1810007	chr6	149798602	149799016	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1815731	chr6	152646233	152646612	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1816545	chr6	153147369	153147422	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1816546	chr6	153147472	153147615	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1816548	chr6	153147810	153148036	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1820189	chr6	154922042	154922324	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1820191	chr6	154922569	154922707	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1822038	chr6	156056182	156056592	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1822051	chr6	156066532	156066762	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1822054	chr6	156067105	156067210	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1822055	chr6	156067194	156067417	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1823230	chr6	156592686	156592863	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1823236	chr6	156593960	156594121	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1823240	chr6	156594352	156594394	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1825066	chr6	157583718	157583927	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1826795	chr6	158680016	158680128	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1827686	chr6	159342493	159342875	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1827790	chr6	159400481	159400873	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1831237	chr6	161574240	161574307	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1832943	chr6	162645709	162646147	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1836983	chr6	164964357	164964395	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1836984	chr6	164964923	164965044	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1836987	chr6	164965234	164965283	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1837690	chr6	165373318	165373689	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1838291	chr6	165727632	165728056	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1840705	chr6	167030034	167030404	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1842703	chr6	168119716	168120107	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1845198	chr6	169175771	169175849	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1845329	chr6	169225855	169226013	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1845331	chr6	169226153	169226366	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1846568	chr6	169749244	169749653	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1848299	chr6	170638638	170639048	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1850301	chr6	171690025	171690418	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1850436	chr6	171762146	171762589	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1854805	chr6	173844381	173844793	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1858357	chr6	176046172	176046287	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1858731	chr6	176272548	176272838	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1858733	chr6	176273111	176273249	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1860037	chr6	176988805	176989195	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1860505	chr6	177185662	177185978	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1860509	chr6	177186337	177186386	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1860513	chr6	177186953	177186988	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1861084	chr6	177493622	177493979	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1861111	chr6	177511702	177512118	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1863250	chr7	2739504	2739810	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1864222	chr7	3212392	3212797	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1864244	chr7	3223353	3223559	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1864246	chr7	3224035	3224261	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1864249	chr7	3224830	3224997	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1864437	chr7	3409061	3409489	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1864459	chr7	3420178	3420606	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1864512	chr7	3448068	3448496	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1864546	chr7	3466871	3467299	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1864743	chr7	3574179	3574484	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1864803	chr7	3610188	3610483	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1864807	chr7	3611428	3611559	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1865105	chr7	3767406	3767564	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1867769	chr7	5516750	5516991	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1869260	chr7	6596507	6596896	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1871340	chr7	8698336	8698630	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1871341	chr7	8698679	8698747	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1871465	chr7	8760285	8760504	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1871466	chr7	8760510	8760564	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1871467	chr7	8760570	8760761	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1872293	chr7	9228290	9228656	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1872858	chr7	9557970	9558381	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1873668	chr7	10075598	10075980	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1874187	chr7	10405974	10406380	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1875324	chr7	11259474	11259890	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1875614	chr7	11430940	11430991	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1875616	chr7	11431372	11431581	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1875617	chr7	11431649	11431691	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1882184	chr7	15830186	15830614	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1886825	chr7	18882591	18882686	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1886827	chr7	18882984	18883324	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1892883	chr7	21859984	21860415	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1893831	chr7	22340934	22341298	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1893835	chr7	22341887	22341952	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1893837	chr7	22342261	22342314	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1896462	chr7	23633060	23633447	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1897367	chr7	24064003	24064051	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1897419	chr7	24095090	24095284	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1897542	chr7	24165282	24165326	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1906148	chr7	29667435	29667500	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1906150	chr7	29667796	29668142	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1911098	chr7	32658368	32658773	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1912325	chr7	33517570	33517923	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1915096	chr7	35074150	35074197	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1915098	chr7	35074502	35074842	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1920731	chr7	38131186	38131524	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1920734	chr7	38132017	38132094	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1923559	chr7	39904955	39905341	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1924651	chr7	40548764	40549119	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1926905	chr7	41869845	41870256	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1927826	chr7	42364190	42364289	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1927828	chr7	42364582	42364926	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1930037	chr7	43363236	43363666	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1934559	chr7	45420844	45420933	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1934561	chr7	45421239	45421555	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1941874	chr7	49198418	49198626	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1941876	chr7	49198928	49199048	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1943452	chr7	50138201	50138530	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1943454	chr7	50138832	50138897	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1953829	chr7	55828514	55828853	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1953831	chr7	55828930	55828986	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1954289	chr7	56078661	56079052	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1955900	chr7	57070737	57070883	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1956336	chr7	57271205	57271268	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1956339	chr7	57271620	57271915	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1959159	chr7	58695350	58695731	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1959834	chr7	59069371	59069501	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1959836	chr7	59069812	59070114	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1968539	chr7	64352071	64352216	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1968541	chr7	64352509	64352776	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1972489	chr7	66659533	66659935	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1973129	chr7	67090527	67090901	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1973293	chr7	67192757	67193163	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1974624	chr7	68021592	68021963	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1974631	chr7	68024464	68024854	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1977022	chr7	69210644	69210682	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1977023	chr7	69210679	69210939	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1983245	chr7	72532833	72533268	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1983536	chr7	72642974	72643203	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1990177	chr7	76834254	76834654	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1990785	chr7	77237006	77237398	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1992299	chr7	78237095	78237520	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1992572	chr7	78389778	78390192	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1996268	chr7	80724553	80724929	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1996791	chr7	81088519	81088894	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1999664	chr7	83040516	83040904	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER1999667	chr7	83041453	83041507	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2005696	chr7	86576770	86577138	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2006041	chr7	86799136	86799437	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2008282	chr7	88375089	88375459	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2008835	chr7	88766313	88766718	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2011145	chr7	90340406	90340720	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2011147	chr7	90340812	90340862	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2013979	chr7	92202006	92202145	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2014005	chr7	92222218	92222691	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2014863	chr7	92885699	92886068	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2014891	chr7	92900068	92900231	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2030003	chr7	102000088	102000221	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2039537	chr7	108121936	108122352	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2040472	chr7	108574441	108574866	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2041422	chr7	109267704	109267822	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2049625	chr7	114208296	114208691	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2050018	chr7	114435869	114436268	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2050992	chr7	115044717	115045112	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2051050	chr7	115083190	115083605	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2053798	chr7	116662582	116662962	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2054343	chr7	117012301	117012709	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2054684	chr7	117252639	117253068	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2059365	chr7	119947584	119947942	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2062124	chr7	121570837	121570902	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2062126	chr7	121571196	121571513	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2063908	chr7	122762793	122763248	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2065251	chr7	123598596	123598974	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2066223	chr7	124190731	124191166	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2070853	chr7	126872132	126872305	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2077090	chr7	130500453	130500875	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2077193	chr7	130549176	130549425	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2077195	chr7	130549729	130549935	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2082884	chr7	133672286	133672442	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2084755	chr7	134669899	134669953	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2084757	chr7	134670282	134670669	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2085106	chr7	134898579	134898914	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2085109	chr7	134899419	134899498	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2087928	chr7	136489675	136489797	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2092352	chr7	138522992	138523206	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2092354	chr7	138523348	138523547	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2097728	chr7	141208271	141208317	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2097730	chr7	141208638	141208690	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2102206	chr7	144110185	144110576	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2104295	chr7	145320405	145320510	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2104297	chr7	145320642	145320885	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2104331	chr7	145344355	145344691	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2105382	chr7	146037744	146038198	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2105637	chr7	146198381	146198749	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2105639	chr7	146199015	146199129	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2106690	chr7	146932291	146932689	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2108888	chr7	148311682	148312067	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2110201	chr7	149147311	149147679	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2111248	chr7	149834729	149835143	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2111436	chr7	149943728	149943998	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2111439	chr7	149944533	149944606	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2112803	chr7	150777879	150778276	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2116140	chr7	152666444	152666510	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2116941	chr7	153068918	153069288	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2121068	chr7	155150121	155150533	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2122545	chr7	155958458	155958531	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2123637	chr7	156520984	156521332	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2124720	chr7	157096220	157096284	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2124722	chr7	157096650	157097015	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2126768	chr7	158179102	158179523	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2128472	chr7	159035244	159035612	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2129587	chr7	159614456	159614869	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2129852	chr7	159738390	159738596	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2130911	chr7	160299941	160300341	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2131977	chr7	160931015	160931407	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2131981	chr7	160931952	160932377	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2134812	chr7	162570456	162570685	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2134814	chr7	162570993	162571191	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2138894	chr7	164993107	164993514	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2139302	chr7	165225148	165225537	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2144455	chr7	167987361	167987769	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2145858	chr7	168899180	168899238	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2151059	chr8	3299873	3300241	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2151488	chr8	3582781	3583241	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2153745	chr8	5227600	5227941	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2156809	chr8	7954790	7954956	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2157116	chr8	8211210	8211596	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2157135	chr8	8228647	8229028	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2162470	chr8	11658361	11658508	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2169430	chr8	15870309	15870733	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2176362	chr8	20016905	20017292	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2176501	chr8	20090828	20091242	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2181832	chr8	23128658	23128812	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2181834	chr8	23129237	23129287	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2182372	chr8	23495801	23496226	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2185239	chr8	25139960	25140361	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2188132	chr8	26699167	26699592	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2189777	chr8	27652813	27653239	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2190002	chr8	27770228	27770662	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2191074	chr8	28336119	28336503	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2191795	chr8	28693546	28693931	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2193857	chr8	29830797	29831212	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2194023	chr8	29922240	29922673	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2196745	chr8	31217049	31217421	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2201391	chr8	33972677	33972774	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2203714	chr8	35401050	35401452	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2203882	chr8	35490473	35490902	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2204701	chr8	36046028	36046299	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2204703	chr8	36046335	36046441	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2204705	chr8	36047492	36047587	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2205886	chr8	36810142	36810529	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2206868	chr8	37475299	37475728	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2207921	chr8	38103175	38103569	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2208764	chr8	38516293	38516689	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2209904	chr8	39117041	39117474	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2211441	chr8	40037141	40037431	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2218012	chr8	43588216	43588418	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2218014	chr8	43588712	43588869	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2218016	chr8	43589159	43589227	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2218019	chr8	43590032	43590086	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2218420	chr8	43805776	43805833	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2218652	chr8	44147867	44148226	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2220677	chr8	50088835	50089227	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2230068	chr8	56321883	56322075	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2230070	chr8	56322212	56322446	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2232371	chr8	57571991	57572037	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2232373	chr8	57572481	57572797	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2235694	chr8	59609342	59609383	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2235696	chr8	59609695	59610068	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2235727	chr8	59624979	59625009	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2235737	chr8	59627965	59628371	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2235790	chr8	59658846	59659260	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2241515	chr8	63475590	63475737	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2241832	chr8	63682413	63682832	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2242336	chr8	63999498	63999907	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2242715	chr8	64276086	64276165	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2245140	chr8	65846436	65846802	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2248347	chr8	68065818	68066215	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2248503	chr8	68156972	68157375	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2248587	chr8	68203660	68204000	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2256145	chr8	72464214	72464574	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2257687	chr8	73323984	73324072	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2257689	chr8	73324660	73324999	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2257756	chr8	73375302	73375707	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2258526	chr8	73917086	73917519	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2258659	chr8	74024219	74024309	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2259134	chr8	74407188	74407599	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2261474	chr8	75870041	75870474	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2266716	chr8	78976756	78977143	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2267310	chr8	79413454	79413821	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2268008	chr8	79843101	79843390	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2269064	chr8	80622853	80623042	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2269066	chr8	80623401	80623633	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2273570	chr8	83236022	83236448	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2273578	chr8	83238807	83239214	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2274669	chr8	83961491	83961576	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2274671	chr8	83963182	83963520	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2274674	chr8	83964553	83964680	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2274909	chr8	84113733	84114045	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2276457	chr8	85074458	85074859	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2277575	chr8	85799787	85800203	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2279631	chr8	87269028	87269438	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2285195	chr8	91007387	91007801	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2285587	chr8	91257317	91257368	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2285936	chr8	91485293	91485708	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2286096	chr8	91601973	91602385	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2286810	chr8	92050083	92050182	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2298787	chr8	99301069	99301163	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2298791	chr8	99302882	99302979	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2298793	chr8	99303399	99303620	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2298896	chr8	99355454	99355519	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2298897	chr8	99355613	99355743	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2302962	chr8	101511284	101511397	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2307297	chr8	103833129	103833546	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2310010	chr8	105284177	105284520	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2310236	chr8	105399081	105399432	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2310238	chr8	105399757	105399815	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2318964	chr8	110714510	110714617	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2323545	chr8	113527301	113527698	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2323612	chr8	113560915	113561344	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2324462	chr8	114085955	114086199	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2325239	chr8	114594850	114595276	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2328130	chr8	116424167	116424284	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2330255	chr8	117726119	117726530	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2336827	chr8	121805927	121806374	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2339530	chr8	123232190	123232252	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2345832	chr8	126618995	126619402	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2346705	chr8	127050196	127050426	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2349704	chr8	128510905	128510959	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2349706	chr8	128511255	128511598	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2350487	chr8	128945589	128946009	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2354626	chr8	130920677	130920907	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2354628	chr8	130921034	130921191	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2355486	chr8	131393389	131393755	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2357703	chr8	132548074	132548129	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2357705	chr8	132548431	132548837	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2357720	chr8	132553337	132553712	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2359080	chr8	133157975	133158390	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2359772	chr8	133504312	133504686	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2365567	chr8	136535226	136535417	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2365568	chr8	136535764	136535954	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2366392	chr8	136995177	136995446	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2366393	chr8	136995656	136995762	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2366521	chr8	137100286	137100713	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2366772	chr8	137258024	137258440	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2369005	chr8	138462435	138462931	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2370573	chr8	139331281	139331608	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2374719	chr8	141794419	141794801	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2375630	chr8	142373160	142373578	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2378908	chr8	144283051	144283447	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2380332	chr8	145417918	145418333	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2380441	chr8	145593565	145593643	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2380443	chr8	145594112	145594476	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2381502	chr8	146293584	146293713	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2381506	chr8	146295627	146295673	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2381508	chr8	146295837	146296160	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2386241	chr9	1926658	1926877	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2389459	chr9	4222654	4222780	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2389465	chr9	4223620	4223870	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2389790	chr9	4430458	4430571	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2395727	chr9	8083999	8084406	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2398700	chr9	9889909	9890302	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2398871	chr9	9994630	9994998	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2399140	chr9	10148018	10148433	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2401110	chr9	11545163	11545563	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2403983	chr9	12928607	12929024	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2409627	chr9	15944445	15944832	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2412955	chr9	17854861	17854995	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2412963	chr9	17856932	17857196	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2419985	chr9	21850193	21850437	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2421915	chr9	22962050	22962413	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2423013	chr9	23560905	23561321	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2423328	chr9	23692387	23692721	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2423330	chr9	23693064	23693146	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2424526	chr9	24387619	24387720	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2425456	chr9	24923739	24923828	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2427517	chr9	26063198	26063583	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2431192	chr9	28067672	28068071	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2433387	chr9	29217394	29217481	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2433389	chr9	29217783	29217832	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2433391	chr9	29218146	29218371	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2435253	chr9	30200393	30200473	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2435255	chr9	30200771	30201167	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2437160	chr9	31208602	31209027	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2437510	chr9	31401425	31401499	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2437516	chr9	31403391	31403443	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2440050	chr9	32780865	32781261	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2440885	chr9	33326807	33326995	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2440887	chr9	33327297	33327502	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2441215	chr9	33563192	33563608	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2442151	chr9	34119947	34120335	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2444466	chr9	35447975	35448179	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2444468	chr9	35448487	35448615	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2449523	chr9	38803928	38804049	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2450623	chr9	43034723	43035099	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2452135	chr9	43828389	43828821	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2452381	chr9	44012025	44012204	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2452976	chr9	44495465	44495698	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2453672	chr9	45012827	45013252	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2456716	chr9	47055135	47055183	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2456718	chr9	47055502	47055544	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2456723	chr9	47056607	47056894	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2462030	chr9	50649318	50649397	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2462032	chr9	50649485	50649589	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2463539	chr9	51646299	51646568	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2463541	chr9	51646747	51646924	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2465068	chr9	52657774	52658091	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2466916	chr9	53709369	53709403	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2466920	chr9	53710796	53711212	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2468288	chr9	54571684	54571810	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2468951	chr9	54981130	54981507	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2471824	chr9	56812228	56812386	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2471826	chr9	56812683	56812889	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2472688	chr9	57289390	57289574	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2472690	chr9	57289636	57289848	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2473488	chr9	57753241	57753613	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2480862	chr9	62091373	62091448	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2480864	chr9	62091747	62092126	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2482412	chr9	62801337	62801744	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2484447	chr9	63755127	63755540	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2485661	chr9	64295840	64295894	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2485663	chr9	64296185	64296539	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2487456	chr9	65075711	65076106	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2488021	chr9	65365904	65366336	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2489845	chr9	66378815	66378890	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2491727	chr9	67308583	67308969	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2491751	chr9	67322261	67322670	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2491871	chr9	67395430	67395856	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2492839	chr9	67849341	67849700	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2493676	chr9	68206025	68206106	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2495186	chr9	68881624	68881854	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2495188	chr9	68881977	68882096	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2495190	chr9	68882393	68882477	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2498825	chr9	71018152	71018357	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2498826	chr9	71018339	71018449	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2500448	chr9	72000146	72000548	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2505209	chr9	74729001	74729376	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2507967	chr9	76449453	76449887	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2508943	chr9	77041118	77041476	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2510570	chr9	78075591	78076002	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2511971	chr9	79002723	79003127	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2514115	chr9	80342760	80343203	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2514929	chr9	80822272	80822666	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2516148	chr9	81577507	81577919	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2517527	chr9	82442590	82442871	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2517529	chr9	82443189	82443321	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2518164	chr9	82933773	82934148	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2522216	chr9	85492684	85493122	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2524165	chr9	86716652	86716883	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2524167	chr9	86717187	86717401	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2524632	chr9	86989939	86990348	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2524923	chr9	87153165	87153538	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2524925	chr9	87153841	87153933	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2530158	chr9	90308279	90308720	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2530916	chr9	90727483	90727839	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2531278	chr9	90955748	90956063	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2531788	chr9	91232329	91232771	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2532021	chr9	91362814	91363214	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2532786	chr9	91749436	91749856	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2533927	chr9	92217512	92217561	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2533929	chr9	92217856	92218245	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2534841	chr9	92685151	92685204	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2534847	chr9	92686965	92687331	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2536271	chr9	93395788	93396078	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2536274	chr9	93396513	93396586	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2537301	chr9	93920257	93920661	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2537310	chr9	93924231	93924643	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2539386	chr9	95226803	95227221	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2539390	chr9	95228351	95228503	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2539646	chr9	95366036	95366205	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2542414	chr9	96890262	96890398	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2542416	chr9	96890717	96890750	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2551355	chr9	101622533	101622943	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2552676	chr9	102236028	102236429	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2557265	chr9	104657110	104657555	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2558280	chr9	105255937	105256373	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2566540	chr9	110334526	110334910	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2566629	chr9	110381467	110381819	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2567820	chr9	111119557	111119894	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2578078	chr9	117329880	117330112	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2578080	chr9	117330415	117330465	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2582743	chr9	119850705	119850964	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2583457	chr9	120280916	120281334	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2584213	chr9	120770664	120771094	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2584712	chr9	121077500	121077859	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2585544	chr9	121623292	121623687	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2585721	chr9	121691288	121691356	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2585868	chr9	121763466	121763881	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2587933	chr9	123105956	123106091	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2587936	chr9	123106463	123106696	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2588104	chr9	123202838	123202998	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2588108	chr9	123203886	123204141	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2588969	chr9	123740593	123740994	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2589023	chr9	123775487	123775903	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2591398	chr9	125237446	125237882	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2592105	chr9	125684925	125685023	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2592107	chr9	125685329	125685668	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2593216	chr9	126411646	126411722	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2594086	chr9	127122481	127122899	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2594700	chr9	127519511	127519920	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2595680	chr9	128447091	128447502	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2597428	chr9	129956620	129956992	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2597754	chr9	130196923	130197353	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2597962	chr9	130352040	130352439	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2597965	chr9	130354483	130354868	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2598208	chr9	130525832	130525956	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2600423	chr9	132496603	132496818	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2600425	chr9	132498371	132498775	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2601508	chr10	222703	223068	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2603125	chr10	1533108	1533299	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2603286	chr10	1660084	1660507	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2604110	chr10	2450572	2450780	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2604112	chr10	2451090	2451259	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2604114	chr10	2451558	2451608	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2604649	chr10	2881160	2881552	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2610443	chr10	6592592	6592914	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2610479	chr10	6612869	6613267	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2616734	chr10	9808361	9808773	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2618496	chr10	10646364	10646759	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2619967	chr10	11324388	11324753	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2620907	chr10	11820139	11820549	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2623727	chr10	13083253	13083613	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2630311	chr10	15694774	15695200	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2631395	chr10	16228449	16228474	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2631399	chr10	16229693	16230078	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2633107	chr10	17010093	17010184	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2633110	chr10	17010771	17011070	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2633111	chr10	17011101	17011186	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2633163	chr10	17024005	17024205	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2633165	chr10	17024504	17024594	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2634632	chr10	17592832	17592882	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2635141	chr10	17797974	17798377	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2637841	chr10	19016938	19017309	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2640905	chr10	20274581	20274963	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2641863	chr10	20669494	20669857	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2642790	chr10	21041841	21042249	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2643174	chr10	21198893	21199079	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2643222	chr10	21221981	21222348	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2644502	chr10	21921347	21921777	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2653185	chr10	26430645	26430998	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2654162	chr10	26862780	26863007	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2654163	chr10	26863155	26863345	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2658310	chr10	28521659	28521854	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2658375	chr10	28541809	28541881	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2663522	chr10	30679119	30679330	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2663524	chr10	30679481	30679698	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2667063	chr10	32197977	32198088	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2669837	chr10	33262617	33262728	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2670659	chr10	33624363	33624790	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2673361	chr10	34799133	34799542	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2678947	chr10	37387036	37387086	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2678949	chr10	37387394	37387762	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2679599	chr10	37668351	37668642	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2679601	chr10	37668947	37669030	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2680212	chr10	37992200	37992229	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2684539	chr10	40237333	40237720	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2685828	chr10	41080417	41080839	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2687263	chr10	41974292	41974683	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2688358	chr10	42579332	42579787	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2691407	chr10	44364241	44364669	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2693165	chr10	45448899	45449309	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2693348	chr10	45562086	45562516	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2693898	chr10	45930081	45930516	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2694123	chr10	46067968	46068370	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2694139	chr10	46076456	46076561	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2695129	chr10	46709103	46709528	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2697767	chr10	48290593	48290705	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2697780	chr10	48296379	48296804	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2702492	chr10	51152005	51152378	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2704497	chr10	52159862	52160272	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2709240	chr10	55050409	55050862	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2709416	chr10	55155331	55155392	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2710584	chr10	56002827	56003174	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2713435	chr10	58122978	58123341	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2717878	chr10	62366796	62366903	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2717882	chr10	62367660	62367936	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2718308	chr10	62636819	62637214	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2718741	chr10	62863813	62864169	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2718743	chr10	62864451	62864542	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2725376	chr10	66924135	66924460	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2725378	chr10	66924740	66924839	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2731342	chr10	70113795	70114150	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2731344	chr10	70114466	70114529	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2733762	chr10	71073940	71074015	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2746764	chr10	77074064	77074426	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2749145	chr10	78153283	78153607	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2750109	chr10	78668723	78669112	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2759001	chr10	82765674	82766093	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2759209	chr10	82885044	82885162	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2759840	chr10	83166604	83166651	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2759842	chr10	83166952	83167339	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2764785	chr10	85413289	85413555	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2764787	chr10	85413860	85413900	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2764789	chr10	85414223	85414360	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2766153	chr10	86017292	86017372	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2768008	chr10	86826779	86826898	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2769601	chr10	87724656	87724864	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2769604	chr10	87725460	87725625	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2769946	chr10	87906134	87906209	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2770558	chr10	88217458	88217517	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2770560	chr10	88219195	88219639	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2773404	chr10	89660789	89661205	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2774914	chr10	90596344	90596746	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2774917	chr10	90597207	90597246	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2774919	chr10	90597847	90597866	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2780091	chr10	94408069	94408139	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2780093	chr10	94408454	94408615	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2780095	chr10	94408928	94409072	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2780102	chr10	94410882	94410932	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2786399	chr11	3118939	3119345	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2787100	chr11	3525870	3526230	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2795920	chr11	8617545	8617921	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2797377	chr11	9305152	9305616	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2801635	chr11	12061242	12061659	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2807263	chr11	15126636	15126710	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2807265	chr11	15127008	15127035	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2807266	chr11	15127039	15127087	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2808184	chr11	15782139	15782581	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2808751	chr11	16175107	16175497	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2812027	chr11	18426492	18426557	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2813283	chr11	19269085	19269202	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2813435	chr11	19374710	19374993	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2814172	chr11	19769084	19769473	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2814842	chr11	20064487	20064925	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2814846	chr11	20066969	20067355	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2815548	chr11	20514450	20514825	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2815550	chr11	20520907	20520957	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2818848	chr11	22676280	22676688	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2819510	chr11	23053789	23053849	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2819512	chr11	23054332	23054709	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2819807	chr11	23225967	23226266	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2819809	chr11	23227942	23228294	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2821438	chr11	24372445	24372507	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2832476	chr11	31168187	31168531	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2833621	chr11	31713386	31713513	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2834365	chr11	32010821	32010894	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2834367	chr11	32011192	32011448	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2834369	chr11	32011742	32011805	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2834526	chr11	32084349	32084471	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2835315	chr11	32434492	32434906	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2836173	chr11	32865600	32866032	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2836695	chr11	33160092	33160217	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2837104	chr11	33442410	33442786	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2837228	chr11	33516969	33517391	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2837376	chr11	33610820	33611261	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2837729	chr11	33880274	33880692	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2838597	chr11	34487973	34488392	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2842464	chr11	37799513	37799916	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2843426	chr11	38531023	38531126	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2846114	chr11	40069047	40069456	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2852982	chr11	44403092	44403179	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2856777	chr11	46536257	46536384	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2865023	chr11	50722832	50723154	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2865024	chr11	50723189	50723221	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2865026	chr11	50723540	50723575	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2865578	chr11	51016964	51017074	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2866611	chr11	51747801	51747898	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2866613	chr11	51748174	51748185	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2866615	chr11	51748498	51748839	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2867100	chr11	52048150	52048503	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2867846	chr11	52574771	52575131	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2869624	chr11	53467214	53467288	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2874101	chr11	56044628	56045074	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2874632	chr11	56398870	56399233	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2877060	chr11	57973417	57973475	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2877062	chr11	57973764	57973947	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2877064	chr11	57974261	57974381	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2877160	chr11	58029405	58029467	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2882734	chr11	61343902	61344320	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2886266	chr11	63308077	63308307	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2886268	chr11	63308549	63308734	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2886270	chr11	63309034	63309081	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2888638	chr11	64727534	64727944	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2888690	chr11	64756931	64757362	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2888738	chr11	64781569	64781982	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2892095	chr11	66496040	66496454	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2892264	chr11	66589193	66589438	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2897343	chr11	69779696	69779838	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2897344	chr11	69779864	69780015	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2897792	chr11	70065083	70065316	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2898125	chr11	70296229	70296660	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2898383	chr11	70487130	70487559	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2898952	chr11	70878402	70878510	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2901286	chr11	72418157	72418596	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2901290	chr11	72420786	72421136	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2902425	chr11	73085979	73086336	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2903823	chr11	73779945	73780071	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2905847	chr11	75083515	75083938	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2908426	chr11	76725159	76725513	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2908751	chr11	76899502	76899819	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2910017	chr11	77712303	77712613	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2918315	chr11	83016061	83016106	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2918317	chr11	83016395	83016782	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2918587	chr11	83221665	83221746	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2922734	chr11	85414505	85414903	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2922736	chr11	85415202	85415230	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2922739	chr11	85415467	85415514	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2926557	chr11	87324629	87324856	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2926559	chr11	87324923	87325070	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2926561	chr11	87325597	87325672	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2926688	chr11	87395265	87395673	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2928777	chr11	88668866	88669232	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2932524	chr11	90914300	90914720	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2932567	chr11	90935458	90935862	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2932585	chr11	90952100	90952203	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2933084	chr11	91258638	91259076	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2940621	chr11	95337984	95338395	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2945605	chr11	97774312	97774533	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2945607	chr11	97774844	97774872	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2945610	chr11	97775139	97775341	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2946775	chr11	98451588	98451998	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2948661	chr11	99585122	99585487	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2950903	chr11	100833567	100833656	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2950905	chr11	100834023	100834129	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2950907	chr11	100835578	100835998	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2951605	chr11	101235411	101235808	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2952010	chr11	101423054	101423203	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2955977	chr11	103516305	103516669	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2955981	chr11	103518010	103518069	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2957408	chr11	104358878	104358927	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2961568	chr11	106552737	106552856	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2961922	chr11	106737459	106737563	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2962714	chr11	107145658	107145744	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2968671	chr11	109914388	109914438	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2968675	chr11	109914759	109915169	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2969186	chr11	110098205	110098620	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2977364	chr11	113557229	113557308	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2980645	chr11	114915585	114915632	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2983135	chr11	116066623	116067027	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2986408	chr11	117516375	117516765	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2986743	chr11	117635506	117635922	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2990946	chr11	119431187	119431411	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER2994327	chr11	120949220	120949389	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3003696	chr11	125280927	125281318	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3013916	chr11	130604333	130604479	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3013917	chr11	130604493	130604791	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3015198	chr11	131333290	131333689	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3015916	chr11	131787485	131787918	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3019690	chr11	134275026	134275384	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3021085	chr12	1595108	1595505	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3023197	chr12	2897592	2897997	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3024301	chr12	3592583	3593013	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3026061	chr12	4800557	4800925	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3026649	chr12	5193944	5194358	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3029620	chr12	7328203	7328581	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3033602	chr12	10188010	10188376	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3033604	chr12	10188397	10188443	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3034508	chr12	10783603	10783999	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3035944	chr12	11724351	11724481	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3039080	chr12	13917613	13918022	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3042407	chr12	16021797	16021850	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3042409	chr12	16022159	16022452	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3042411	chr12	16022743	16022804	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3044469	chr12	17433511	17433565	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3044470	chr12	17433722	17434100	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3045163	chr12	17983875	17983927	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3045389	chr12	18157966	18158151	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3045391	chr12	18158176	18158292	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3045394	chr12	18158763	18158860	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3045426	chr12	18173956	18174329	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3046666	chr12	19014106	19014547	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3047277	chr12	19442707	19443047	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3049028	chr12	20616875	20617017	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3050653	chr12	21649520	21649925	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3051722	chr12	22373455	22373598	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3051725	chr12	22374019	22374072	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3051727	chr12	22374338	22374520	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3051729	chr12	22374811	22374876	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3051771	chr12	22402649	22402686	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3052140	chr12	22567283	22567424	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3053752	chr12	23559422	23559832	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3060154	chr12	27930935	27931111	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3060155	chr12	27931140	27931262	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3063112	chr12	29886447	29886858	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3064814	chr12	31060511	31060922	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3064816	chr12	31062567	31062984	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3065501	chr12	31547045	31547287	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3065503	chr12	31547423	31547626	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3068379	chr12	33323533	33323952	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3074090	chr12	36276942	36277075	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3075241	chr12	36999818	36999999	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3075242	chr12	37000001	37000245	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3076517	chr12	37776780	37776923	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3083040	chr12	41897726	41898062	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3083042	chr12	41898372	41898439	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3086749	chr12	44580558	44580945	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3087042	chr12	44802401	44802744	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3089017	chr12	46245636	46246060	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3089437	chr12	46521071	46521486	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3090352	chr12	47084891	47085290	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3092018	chr12	48211595	48212021	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3092577	chr12	48610489	48610884	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3092586	chr12	48613972	48614388	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3093721	chr12	49307048	49307337	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3094262	chr12	49661465	49661879	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3094264	chr12	49663597	49664021	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3094919	chr12	50082362	50082794	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3097385	chr12	51733883	51733924	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3098211	chr12	52278304	52278669	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3098213	chr12	52280034	52280465	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3100391	chr12	53702068	53702488	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3100850	chr12	53972058	53972463	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3100856	chr12	53975354	53975771	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3100901	chr12	53997826	53998234	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3100910	chr12	54001405	54001827	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3104119	chr12	56095239	56095462	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3104123	chr12	56095780	56095802	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3104127	chr12	56096306	56096471	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3105124	chr12	56765962	56766081	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3105126	chr12	56766206	56766433	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3110870	chr12	60421458	60421856	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3113666	chr12	62012906	62013293	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3114850	chr12	62798051	62798462	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3115331	chr12	63137333	63137687	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3115334	chr12	63138005	63138058	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3115423	chr12	63197176	63197360	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3115425	chr12	63197672	63197920	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3115438	chr12	63201856	63201918	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3115442	chr12	63202917	63203312	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3119854	chr12	65720449	65720714	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3124265	chr12	67820673	67821135	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3124942	chr12	68251769	68252202	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3126154	chr12	69163628	69164067	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3126662	chr12	69535376	69535771	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3128834	chr12	70767416	70767612	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3128836	chr12	70768217	70768455	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3128850	chr12	70778355	70778759	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3132403	chr12	72995933	72996279	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3132516	chr12	73087298	73087715	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3134115	chr12	74137594	74138029	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3135083	chr12	74870409	74870815	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3136651	chr12	75896304	75896516	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3136655	chr12	75897233	75897464	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3145314	chr12	81326871	81327279	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3145539	chr12	81456676	81456773	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3145543	chr12	81457418	81457715	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3155360	chr12	87172473	87172884	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3157422	chr12	88311880	88312303	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3159596	chr12	89653622	89654003	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3160054	chr12	89938045	89938462	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3161056	chr12	90553688	90554064	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3162916	chr12	91612180	91612233	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3162918	chr12	91612522	91612852	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3166955	chr12	93966091	93966514	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3167781	chr12	94491753	94492169	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3170727	chr12	95968527	95968939	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3174206	chr12	98107780	98108202	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3175351	chr12	98729762	98730112	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3178585	chr12	100888844	100888888	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3178636	chr12	100922899	100923295	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3181050	chr12	102429656	102429979	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3181543	chr12	102827017	102827201	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3182071	chr12	103331743	103332188	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3184905	chr12	105509092	105509474	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3186898	chr13	659487	659598	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3189350	chr13	2755361	2755788	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3189865	chr13	3125720	3126034	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3189867	chr13	3126335	3126403	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3190314	chr13	3458274	3458577	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3191397	chr13	4196355	4196714	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3191401	chr13	4199124	4199165	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3195265	chr13	7028702	7029120	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3195422	chr13	7144315	7144689	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3198686	chr13	9242025	9242377	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3198986	chr13	9416146	9416551	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3199919	chr13	9927486	9927729	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3200724	chr13	10355465	10355880	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3201486	chr13	10784418	10784812	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3202134	chr13	11108804	11108860	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3202138	chr13	11111366	11111631	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3202140	chr13	11112329	11112480	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3205495	chr13	12947509	12947921	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3206476	chr13	13522814	13523230	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3207767	chr13	14298566	14298983	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3209016	chr13	15078570	15078933	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3209018	chr13	15079237	15079292	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3212125	chr13	16807804	16807866	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3212746	chr13	17173000	17173127	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3213894	chr13	17894531	17894906	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3214082	chr13	17998239	17998652	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3214115	chr13	18026678	18027088	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3214190	chr13	18075995	18076414	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3216170	chr13	19375522	19375945	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3216274	chr13	19442948	19443043	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3216276	chr13	19443420	19443698	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3216427	chr13	19554207	19554349	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3218474	chr13	20762574	20762960	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3218477	chr13	20763542	20763598	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3218484	chr13	20764201	20764276	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3218485	chr13	20764277	20764383	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3218877	chr13	21049660	21050048	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3220427	chr13	22105358	22105745	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3221686	chr13	22913477	22913819	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3221921	chr13	23078521	23078616	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3221923	chr13	23078924	23079271	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3226777	chr13	25571302	25571729	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3229065	chr13	26618642	26619009	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3229067	chr13	26619311	26619385	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3231951	chr13	28033793	28034166	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3243940	chr13	34930783	34931206	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3246371	chr13	36586385	36586515	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3246373	chr13	36586819	36587092	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3248589	chr13	37817076	37817394	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3250861	chr13	39032133	39032496	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3251850	chr13	39578388	39578418	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3261691	chr13	45337798	45338072	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3264957	chr13	47334769	47334822	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3266662	chr13	48113235	48113635	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3267270	chr13	48431575	48431936	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3268674	chr13	49255753	49255795	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3268675	chr13	49255854	49256161	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3270606	chr13	50599001	50599426	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3271325	chr13	51102584	51102937	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3272920	chr13	52195793	52196222	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3274432	chr13	53224508	53224638	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3275159	chr13	53720492	53720544	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3275161	chr13	53720983	53721315	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3275609	chr13	53973497	53973865	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3280622	chr13	56843824	56844254	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3280807	chr13	56968373	56968694	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3280809	chr13	56969429	56969457	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3282341	chr13	58029567	58029938	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3284965	chr13	59867116	59867503	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3286459	chr13	60880661	60880713	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3286461	chr13	60880856	60880908	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3286463	chr13	60881216	60881278	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3289567	chr13	62142043	62142157	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3289569	chr13	62143001	62143195	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3289571	chr13	62143495	62143505	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3292511	chr13	63756986	63757191	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3292634	chr13	63832709	63832934	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3292824	chr13	63943023	63943435	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3297195	chr13	66389528	66389593	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3297197	chr13	66389900	66389952	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3297201	chr13	66393025	66393424	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3304226	chr13	70685686	70685870	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3304228	chr13	70686171	70686406	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3305454	chr13	71391636	71392023	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3308385	chr13	73200806	73201223	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3309413	chr13	73724575	73724996	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3310472	chr13	74275025	74275084	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3310474	chr13	74275377	74275771	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3313316	chr13	75895606	75895976	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3313957	chr13	76278708	76279156	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3316823	chr13	78139169	78139586	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3318008	chr13	78910510	78910851	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3318046	chr13	78938306	78938699	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3318211	chr13	79033357	79033772	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3318941	chr13	79496911	79496984	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3318962	chr13	79511011	79511157	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3318967	chr13	79513204	79513317	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3319872	chr13	80130351	80130707	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3324796	chr13	83526293	83526373	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3324798	chr13	83526693	83527030	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3324894	chr13	83572202	83572268	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3333047	chr13	88708134	88708552	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3333891	chr13	89036477	89036704	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3333893	chr13	89037012	89037206	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3334599	chr13	89459554	89459747	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3336877	chr13	96728460	96728527	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3336879	chr13	96728614	96729006	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3337119	chr13	96875555	96875711	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3340940	chr13	99195131	99195152	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3340944	chr13	99196421	99196725	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3344564	chr13	101394544	101394585	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3344566	chr13	101394885	101395249	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3345124	chr13	101685585	101685981	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3348067	chr13	103790872	103791229	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3348070	chr13	103791617	103791657	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3348677	chr13	104201324	104201757	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3352094	chr13	106379556	106379668	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3355749	chr13	108614595	108614828	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3355753	chr13	108615431	108615529	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3356375	chr13	108985907	108986279	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3356657	chr13	109216947	109217321	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3359012	chr13	110779661	110780017	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3359133	chr13	110876732	110877133	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3359886	chr13	111353314	111353702	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3361109	chr13	111949923	111950223	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3363549	chr13	113937353	113937754	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3364836	chr13	114865555	114865937	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3365815	chr13	115549343	115549759	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3366870	chr13	116177135	116177187	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3366872	chr13	116177481	116177810	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3368240	chr13	116893933	116894382	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3368662	chr13	117106179	117106256	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3368664	chr13	117106559	117106853	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3368992	chr13	117263277	117263648	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3369589	chr13	117560416	117560545	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3370963	chr13	118486591	118487042	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3372529	chr13	119590939	119591255	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3372531	chr13	119591559	119591640	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3372620	chr13	119643806	119644007	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3372626	chr13	119645750	119645978	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3373534	chr13	120155932	120156323	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3374146	chr13	120532162	120532535	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3376467	chr13	121997589	121998008	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3377556	chr13	122734357	122734747	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3377563	chr13	122739540	122740013	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3377877	chr13	122945474	122945913	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3381563	chr13	125343726	125344093	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3385943	chr13	127807175	127807580	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3387438	chr13	128572416	128572788	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3390513	chr13	130487991	130488369	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3393505	chr13	132391320	132391669	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3393510	chr13	132393505	132393897	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3394908	chr13	133299663	133299758	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3394910	chr13	133300043	133300386	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3397711	chr13	134827287	134827328	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3397715	chr13	134827959	134828361	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3399058	chr13	135677142	135677437	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3399886	chr13	136250490	136250617	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3400184	chr13	136409565	136409754	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3400186	chr13	136409859	136410057	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3400976	chr13	137515835	137516227	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3402879	chr14	690586	690712	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3402880	chr14	690698	691006	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3402883	chr14	691479	691546	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3405419	chr14	3043557	3043916	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3406546	chr14	3710864	3711228	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3409125	chr14	5223901	5224318	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3409177	chr14	5252549	5252735	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3409179	chr14	5253140	5253393	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3414608	chr14	7997585	7997717	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3415702	chr14	8515793	8515843	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3420337	chr14	10877146	10877312	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3420339	chr14	10877587	10877656	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3428080	chr14	15108658	15109026	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3428710	chr14	15460749	15461170	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3430048	chr14	16050959	16051171	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3430055	chr14	16053157	16053571	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3436956	chr14	26093847	26094255	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3439111	chr14	27209402	27209812	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3439810	chr14	27543052	27543374	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3443036	chr14	29323854	29324274	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3444136	chr14	29942398	29942821	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3445084	chr14	30508642	30508684	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3445087	chr14	30509006	30509136	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3445089	chr14	30509223	30509380	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3448199	chr14	32410226	32410615	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3458737	chr14	38622325	38622406	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3458739	chr14	38622701	38623020	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3462945	chr14	40863700	40863745	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3462948	chr14	40864118	40864494	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3466153	chr14	42806655	42807061	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3468977	chr14	44503358	44503783	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3469544	chr14	44828735	44828937	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3469545	chr14	44828973	44829023	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3469635	chr14	44881574	44881988	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3470416	chr14	45366714	45366742	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3470481	chr14	45411857	45412270	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3471322	chr14	45942998	45943189	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3475253	chr14	48521254	48521661	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3478632	chr14	50561891	50562006	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3478634	chr14	50562430	50562708	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3479159	chr14	50869889	50870244	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3479612	chr14	51149949	51150388	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3479746	chr14	51225025	51225379	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3483588	chr14	53414942	53415340	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3489875	chr14	56967979	56968393	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3489901	chr14	56993379	56993745	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3492802	chr14	58635832	58636226	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3494203	chr14	59450259	59450527	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3494205	chr14	59450878	59451001	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3494207	chr14	59451196	59451277	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3495582	chr14	60279810	60280233	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3503369	chr14	64725676	64726162	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3507596	chr14	68564183	68564565	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3513302	chr14	71593006	71593156	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3516793	chr14	73161278	73161532	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3516795	chr14	73161556	73161666	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3518145	chr14	73790518	73790950	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3518663	chr14	74010441	74010757	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3518919	chr14	74119239	74119312	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3525454	chr14	77126204	77126532	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3526771	chr14	77792661	77792897	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3527980	chr14	78434712	78434796	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3528551	chr14	78755534	78755639	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3528838	chr14	78914556	78914974	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3530438	chr14	79813594	79813823	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3531496	chr14	80450524	80450582	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3535510	chr14	82622202	82622591	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3537470	chr14	83815929	83816115	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3537473	chr14	83816719	83816953	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3539082	chr14	84675121	84675169	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3539084	chr14	84675441	84675776	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3539642	chr14	85088519	85088797	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3542175	chr14	86533396	86533784	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3542177	chr14	86535325	86535762	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3546382	chr14	89373312	89373398	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3546384	chr14	89373728	89374129	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3547172	chr14	89895287	89895474	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3547175	chr14	89895938	89896065	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3549369	chr14	91326658	91327066	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3549777	chr14	91587905	91588261	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3554011	chr14	94119560	94119993	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3555147	chr14	94817901	94818296	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3565598	chr14	101610920	101611373	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3566433	chr14	102123369	102123750	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3567170	chr14	102589512	102589915	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3567484	chr14	102787684	102787772	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3569534	chr14	104119623	104120080	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3571928	chr14	105668114	105668544	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3573215	chr14	106424866	106424918	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3573218	chr14	106425570	106425755	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3575468	chr14	107526727	107527150	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3579678	chr14	110023861	110023900	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3579680	chr14	110024215	110024592	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3583654	chr14	112370462	112370532	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3585966	chr14	113808448	113808694	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3585968	chr14	113808996	113809175	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3591968	chr14	117109688	117109768	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3593882	chr14	117991995	117992334	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3597903	chr14	120437239	120437665	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3600105	chr14	121570630	121571040	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3600381	chr14	121694410	121694604	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3600383	chr14	121694979	121695181	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3600404	chr14	121701100	121701500	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3600496	chr14	121753358	121753723	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3600750	chr14	121861051	121861340	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3600752	chr14	121861651	121861722	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3601816	chr14	122497040	122497402	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3604066	chr14	123870232	123870340	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3604068	chr14	123871179	123871442	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3604069	chr14	123871583	123871652	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3606972	chr14	125764429	125764835	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3607131	chr14	125904421	125904650	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3608817	chr14	127068518	127068882	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3609762	chr14	127660665	127660757	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3614758	chr14	130978810	130979249	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3615758	chr14	131713568	131713971	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3618154	chr15	438871	439057	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3618768	chr15	830036	830073	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3618770	chr15	830355	830725	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3619325	chr15	1293087	1293351	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3619327	chr15	1293650	1293705	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3622590	chr15	3693415	3693760	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3622592	chr15	3694070	3694151	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3624871	chr15	5543622	5543730	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3624876	chr15	5544600	5544879	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3625385	chr15	5795443	5795544	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3625387	chr15	5795843	5795905	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3632761	chr15	9536547	9536958	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3638717	chr15	12457154	12457464	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3638719	chr15	12457822	12457947	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3639786	chr15	13042698	13043083	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3640047	chr15	13429030	13429448	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3648203	chr15	17374972	17375278	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3651042	chr15	18915279	18915712	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3659205	chr15	22901233	22901477	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3662155	chr15	24305654	24306062	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3668882	chr15	27898185	27898492	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3672900	chr15	29949745	29949938	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3672903	chr15	29950369	29950772	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3674502	chr15	30896087	30896469	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3676077	chr15	31689989	31690396	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3679313	chr15	33786877	33787294	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3681488	chr15	35157923	35158325	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3682678	chr15	35829872	35830142	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3687304	chr15	38123678	38124001	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3690391	chr15	39662306	39662385	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3693155	chr15	40954235	40954589	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3693157	chr15	40954901	40954955	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3696647	chr15	42849870	42849910	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3696649	chr15	42850112	42850466	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3699936	chr15	44394187	44394548	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3701435	chr15	45284696	45285105	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3701437	chr15	45286085	45286322	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3703729	chr15	46785998	46786401	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3709789	chr15	50566228	50566584	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3710553	chr15	51049065	51049472	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3710596	chr15	51082551	51082961	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3711118	chr15	51417575	51418015	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3711282	chr15	51518175	51518537	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3712248	chr15	52129026	52129394	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3714621	chr15	53718565	53719005	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3719173	chr15	56734833	56735249	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3719979	chr15	57212411	57212804	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3720405	chr15	57491251	57491620	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3723986	chr15	59647754	59648182	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3724227	chr15	59820680	59820735	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3724229	chr15	59821056	59821260	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3724231	chr15	59821533	59821611	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3726450	chr15	61286881	61287286	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3727628	chr15	61820589	61820658	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3727629	chr15	61820709	61821075	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3729387	chr15	63059686	63059726	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3729389	chr15	63060020	63060408	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3731136	chr15	64225041	64225396	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3733902	chr15	66052146	66052507	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3735645	chr15	67249161	67249574	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3737041	chr15	68226181	68226411	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3737043	chr15	68226694	68226867	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3739778	chr15	70141898	70141981	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3741297	chr15	70889442	70889530	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3741784	chr15	71170892	71171276	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3743085	chr15	71923576	71923998	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3743115	chr15	71949972	71950123	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3743145	chr15	71978698	71979061	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3743933	chr15	72458563	72458937	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3744161	chr15	72560530	72560854	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3745203	chr15	73140741	73141135	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3749547	chr15	75976429	75976800	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3750504	chr15	76564741	76564871	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3750615	chr15	76631987	76632374	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3751021	chr15	76876708	76877111	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3751573	chr15	77190024	77190432	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3752701	chr15	77839519	77839901	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3753468	chr15	78270393	78270730	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3753765	chr15	78467380	78467795	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3757050	chr15	80443019	80443322	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3758135	chr15	80945748	80945918	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3758535	chr15	81144656	81144729	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3758537	chr15	81145015	81145450	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3759400	chr15	81622251	81622687	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3759604	chr15	81768231	81768629	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3762273	chr15	83540083	83540483	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3763139	chr15	83936508	83936596	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3766438	chr15	85856978	85857317	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3766441	chr15	85857641	85857717	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3769793	chr15	87913026	87913471	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3771834	chr15	89253790	89253962	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3776186	chr15	92019549	92019866	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3777636	chr15	92786140	92786342	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3777638	chr15	92786805	92786881	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3777655	chr15	92796656	92796879	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3779008	chr15	93540131	93540549	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3781620	chr15	95053124	95053363	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3781622	chr15	95054310	95054453	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3781821	chr15	95156240	95156683	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3782075	chr15	95304257	95304625	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3783379	chr15	96062366	96062768	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3783671	chr15	96260724	96260970	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3783751	chr15	96318803	96319226	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3783859	chr15	96409380	96409579	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3784850	chr15	96819432	96819485	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3784852	chr15	96819780	96820095	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3786375	chr15	97812688	97813053	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3786753	chr15	98077935	98078308	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3786755	chr15	98078613	98078661	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3786878	chr15	98187887	98188263	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3790866	chr15	100251945	100252342	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3794009	chr15	101928964	101929371	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3795638	chr15	102936557	102936700	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3798694	chr15	104695843	104696233	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3800701	chr15	105934605	105934904	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3800703	chr15	105935322	105935465	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3801071	chr15	106087572	106087692	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3803903	chr15	107866353	107866753	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3804127	chr15	107997450	107997831	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3805133	chr15	108460204	108460609	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3819367	chr16	6159507	6159820	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3820410	chr16	6743868	6744172	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3820413	chr16	6744496	6744593	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3820421	chr16	6746987	6747177	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3823201	chr16	8286194	8286610	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3823718	chr16	8529858	8530263	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3824790	chr16	9085888	9085938	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3824792	chr16	9086251	9086371	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3825901	chr16	9565196	9565614	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3828278	chr16	10807347	10807752	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3828280	chr16	10809347	10809775	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3828506	chr16	10920272	10920321	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3828508	chr16	10920618	10920975	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3832503	chr16	13120881	13121256	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3833854	chr16	13842756	13843145	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3834148	chr16	14054017	14054155	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3837182	chr16	15853182	15853559	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3840124	chr16	17314680	17315101	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3844661	chr16	19547535	19547935	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3847615	chr16	22528700	22528881	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3858005	chr16	27682143	27682237	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3860613	chr16	29074967	29075414	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3860615	chr16	29076446	29076573	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3862358	chr16	30032269	30032616	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3862360	chr16	30033202	30033301	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3871610	chr16	34915342	34915567	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3871612	chr16	34915886	34916099	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3873208	chr16	35683609	35684010	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3878017	chr16	38533400	38533802	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3882907	chr16	41289699	41290052	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3882909	chr16	41290361	41290429	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3884941	chr16	42366849	42367273	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3885075	chr16	42455946	42456262	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3885571	chr16	42788600	42788655	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3885574	chr16	42789103	42789411	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3888408	chr16	43953681	43954080	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3890252	chr16	44727553	44727967	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3892538	chr16	46001293	46001677	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3892540	chr16	46001970	46002017	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3908460	chr16	54330276	54330301	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3908462	chr16	54330573	54330760	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3908472	chr16	54333466	54333610	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3921399	chr16	60981187	60981234	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3921401	chr16	60981543	60981863	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3921403	chr16	60982166	60982208	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3922942	chr16	61851395	61851578	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3926949	chr16	63860451	63860530	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3926952	chr16	63860898	63860989	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3926954	chr16	63861230	63861504	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3927161	chr16	63965405	63965808	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3930610	chr16	65988980	65989119	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3934584	chr16	68367509	68367601	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3934586	chr16	68367897	68368191	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3936706	chr16	69466763	69467154	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3937414	chr16	69848081	69848498	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3941552	chr16	71944706	71944791	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3941554	chr16	71944865	71944931	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3943754	chr16	73023876	73024255	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3945385	chr16	73930501	73930554	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3945387	chr16	73930848	73930901	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3956206	chr17	2279502	2279671	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3957931	chr17	3497917	3498017	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3957944	chr17	3504008	3504418	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3958929	chr17	4126903	4127276	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3959032	chr17	4180868	4181266	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3962938	chr17	6651508	6651663	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3963238	chr17	6816233	6816659	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3963540	chr17	6970530	6970983	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3964001	chr17	7200767	7201193	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3964463	chr17	7476525	7476696	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3964465	chr17	7477000	7477198	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3967861	chr17	9461774	9461816	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3967866	chr17	9462345	9462751	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3968799	chr17	9958183	9958364	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3969546	chr17	10367713	10368084	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3970593	chr17	11060590	11060957	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3971365	chr17	11570450	11570846	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3974478	chr17	13387093	13387510	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3975741	chr17	14149975	14150401	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3976609	chr17	14728612	14729059	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3979258	chr17	16432163	16432581	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3979639	chr17	16674244	16674619	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3979820	chr17	16820339	16820742	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3984499	chr17	19782715	19783096	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3985393	chr17	20216498	20216881	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3985395	chr17	20217175	20217245	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3985412	chr17	20221702	20222074	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3986878	chr17	21064381	21064798	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3991114	chr17	23680912	23681322	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3991510	chr17	23891289	23891682	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3992195	chr17	24190993	24191392	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3996143	chr17	26560421	26560850	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER3997180	chr17	27124532	27124778	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4001243	chr17	29472104	29472491	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4003316	chr17	30795059	30795453	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4008557	chr17	34174036	34174155	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4008692	chr17	34258643	34259057	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4009649	chr17	34838154	34838607	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4009895	chr17	34992037	34992395	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4010393	chr17	35325237	35325451	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4010701	chr17	35510458	35510620	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4011317	chr17	35902373	35902737	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4012037	chr17	36393249	36393592	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4019009	chr17	41236564	41236814	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4019011	chr17	41237079	41237132	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4019549	chr17	41824395	41824776	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4021471	chr17	43120704	43120788	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4022908	chr17	44124006	44124234	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4022910	chr17	44124345	44124548	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4023057	chr17	44232120	44232498	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4027697	chr17	47782216	47782359	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4027701	chr17	47783186	47783469	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4029469	chr17	48877522	48877932	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4030695	chr17	49671984	49672410	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4030863	chr17	49785847	49785975	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4032015	chr17	50465675	50466068	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4035266	chr17	52635013	52635135	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4038227	chr17	54360055	54360438	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4039179	chr17	55000679	55000807	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4039183	chr17	55001917	55002331	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4040222	chr17	55665583	55665618	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4040223	chr17	55665617	55665736	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4040295	chr17	55711027	55711339	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4042117	chr17	56915717	56915957	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4042236	chr17	56995236	56995657	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4045050	chr17	58858051	58858107	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4045052	chr17	58858412	58858478	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4048272	chr17	60919556	60919625	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4048274	chr17	60919926	60920282	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4052589	chr17	63698108	63698290	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4052590	chr17	63698302	63698416	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4053646	chr17	64397572	64397866	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4055361	chr17	65499459	65499545	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4056246	chr17	66037155	66037509	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4057071	chr17	66548847	66548909	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4057072	chr17	66548909	66548983	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4057075	chr17	66550784	66551067	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4059845	chr17	68302920	68303294	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4060920	chr17	69024610	69025028	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4060922	chr17	69026667	69027075	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4062295	chr17	69905557	69905996	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4063135	chr17	70385856	70386266	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4065369	chr17	71885882	71885952	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4065371	chr17	71886259	71886592	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4066316	chr17	72487398	72487441	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4066417	chr17	72550936	72551023	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4067276	chr17	73160115	73160568	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4067476	chr17	73308628	73309000	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4067651	chr17	73416497	73416929	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4069887	chr17	74922386	74922799	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4074862	chr17	77936713	77936867	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4075545	chr17	78315659	78315925	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4088879	chr17	86773360	86773775	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4089786	chr17	87396659	87397024	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4089945	chr17	87502499	87502923	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4092011	chr17	88994236	88994630	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4093139	chr17	89779169	89779551	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4095228	chr17	91351896	91351961	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4096874	chr17	93177005	93177374	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4102289	chr18	3326774	3327206	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4102339	chr18	3358544	3358940	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4103549	chr18	4156758	4157170	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4104352	chr18	4698751	4699172	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4107317	chr18	6400292	6400420	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4107319	chr18	6400687	6400982	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4108551	chr18	7161788	7161949	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4108555	chr18	7162611	7162676	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4109123	chr18	7556966	7557333	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4109392	chr18	7732507	7732576	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4109394	chr18	7732710	7733073	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4109786	chr18	7968225	7968639	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4114108	chr18	10782668	10782739	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4114110	chr18	10783033	10783345	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4114852	chr18	11144669	11145025	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4115883	chr18	11663990	11664157	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4118582	chr18	13325488	13325871	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4121220	chr18	14635316	14635725	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4129561	chr18	19417857	19418275	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4131479	chr18	20620268	20620682	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4135928	chr18	23445571	23445757	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4135929	chr18	23445756	23445797	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4136379	chr18	23721106	23721508	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4137725	chr18	24687278	24687665	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4141888	chr18	27380994	27381420	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4142451	chr18	27757702	27758111	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4143349	chr18	28338176	28338591	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4144246	chr18	28857616	28857823	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4144248	chr18	28857944	28858009	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4151415	chr18	33842834	33843250	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4153451	chr18	35203415	35203826	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4155043	chr18	36218662	36219068	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4155045	chr18	36220804	36220865	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4155050	chr18	36221829	36222107	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4155783	chr18	36716021	36716404	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4155991	chr18	36829850	36830250	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4159407	chr18	39120216	39120418	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4159409	chr18	39120731	39120945	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4160410	chr18	39619525	39619624	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4161865	chr18	40504133	40504459	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4162205	chr18	40721692	40721876	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4162207	chr18	40722255	40722492	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4164516	chr18	42139977	42140391	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4164655	chr18	42211823	42212247	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4165282	chr18	42511835	42512041	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4165290	chr18	42513471	42513675	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4165761	chr18	42707070	42707487	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4168058	chr18	44114831	44115184	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4168065	chr18	44116295	44116369	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4168509	chr18	44341629	44341833	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4168511	chr18	44342116	44342348	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4171562	chr18	46234305	46234670	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4171566	chr18	46237818	46237896	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4176349	chr18	49469116	49469498	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4180162	chr18	51810002	51810436	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4183311	chr18	53569860	53570284	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4185825	chr18	55282004	55282073	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4185827	chr18	55282408	55282796	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4195172	chr18	61140864	61141296	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4197611	chr18	62687044	62687413	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4197724	chr18	62758369	62758754	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4199127	chr18	63694731	63695147	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4201352	chr18	65088934	65089005	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4203043	chr18	66132045	66132424	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4205580	chr18	67815265	67815587	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4205582	chr18	67815897	67815975	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4207889	chr18	69649310	69649732	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4208360	chr18	70075049	70075436	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4208546	chr18	70185427	70185533	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4208547	chr18	70185720	70185915	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4208549	chr18	70186352	70186431	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4209052	chr18	70520141	70520505	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4210409	chr18	71564808	71564960	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4210411	chr18	71565261	71565474	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4211593	chr18	72597097	72597531	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4217384	chr19	2631775	2632118	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4226650	chr19	7087564	7087804	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4228207	chr19	7891766	7891997	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4236211	chr19	11504769	11504806	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4236213	chr19	11505100	11505464	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4236352	chr19	11554273	11554367	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4236354	chr19	11554649	11554979	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4236471	chr19	11603080	11603152	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4236478	chr19	11604447	11604533	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4237452	chr19	12040342	12040773	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4237587	chr19	12092548	12092957	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4237704	chr19	12140958	12141231	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4240015	chr19	13125074	13125186	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4240511	chr19	13315425	13315669	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4246760	chr19	16091925	16092081	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4246762	chr19	16092395	16092588	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4247148	chr19	16289052	16289116	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4247152	chr19	16289763	16289776	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4247154	chr19	16290012	16290388	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4247866	chr19	16597214	16597269	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4247870	chr19	16597862	16597946	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4262806	chr19	35285928	35286140	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4262808	chr19	35286446	35286614	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4262810	chr19	35288186	35288567	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4262998	chr19	35401499	35401778	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4263418	chr19	35630763	35630854	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4263419	chr19	35630873	35630992	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4263474	chr19	35673354	35673656	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4267440	chr19	38204307	38204723	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4268295	chr19	38718093	38718476	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4276820	chr19	42809644	42810067	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4276871	chr19	42826053	42826478	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4282985	chr19	45575803	45575878	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4282987	chr19	45576165	45576407	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4287526	chr19	47751282	47751422	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4292972	chr19	50895514	50895941	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4293128	chr19	50975710	50976095	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4305549	chr19	56311170	56311254	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4311801	chr19	59171344	59171626	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4312070	chr19	59327419	59327807	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4313982	chr19	60177665	60177706	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4313985	chr19	60178224	60178633	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4319634	chr19	63013574	63013648	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4321649	chr19	64039683	64039952	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4321651	chr19	64040308	64040327	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4322961	chr20	401813	401851	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4325212	chr20	2216721	2216808	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4328652	chr20	4185739	4186044	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4339364	chr20	9297369	9297608	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4340572	chr20	9834975	9835469	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4343086	chr20	10967539	10967955	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4343779	chr20	11313883	11314299	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4345909	chr20	12191619	12191684	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4345911	chr20	12191991	12192371	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4347307	chr20	12838303	12838528	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4347309	chr20	12838830	12839069	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4359390	chr20	18063872	18064095	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4361518	chr20	18877188	18877609	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4361714	chr20	18960610	18961028	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4362979	chr20	19472356	19472401	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4362981	chr20	19473024	19473354	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4364843	chr20	20338237	20338667	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4365772	chr20	20713105	20713546	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4366514	chr20	21035056	21035163	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4367248	chr20	21361888	21362339	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4367323	chr20	21394619	21394813	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4367327	chr20	21395280	21395510	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4374396	chr20	24286270	24286667	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4375966	chr20	25040326	25040357	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4378574	chr20	26133383	26133777	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4380056	chr20	26774410	26774459	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4387536	chr20	44949268	44949638	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4388176	chr20	45223961	45224333	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4388178	chr20	45224632	45224686	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4388725	chr20	45522898	45523073	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4388727	chr20	45523456	45523563	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4392827	chr20	47770714	47771040	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4399177	chr20	51111860	51112232	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4399700	chr20	51331798	51332205	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4405128	chr20	54250048	54250219	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4405133	chr20	54251489	54251919	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4405248	chr20	54307091	54307494	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4405541	chr20	54458810	54459221	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4408162	chr20	55744169	55744582	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4412262	chr20	57719044	57719123	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4412265	chr20	57719946	57720002	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4412267	chr20	57720295	57720484	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4414416	chr20	58989471	58989877	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4417513	chr20	60926290	60926709	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4418318	chr20	61415474	61415521	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4418320	chr20	61415824	61416201	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4418323	chr20	61417581	61417993	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4419805	chr20	62322647	62323069	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4423619	chr20	64556717	64557119	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4424105	chr20	64794516	64794879	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4427993	chr20	66776754	66777115	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4428065	chr20	66818562	66818876	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4428066	chr20	66818920	66818962	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4428686	chr20	67072095	67072196	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4431116	chr20	68090632	68090746	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4442191	chr20	73782829	73782866	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4442194	chr20	73783805	73784165	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4442378	chr20	73855113	73855528	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4448803	chr20	77553829	77554003	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4448805	chr20	77554305	77554544	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4449941	chr20	78180617	78181042	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4449943	chr20	78181767	78182015	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4457661	chr20	82147367	82147656	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4457667	chr20	82148858	82148998	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4457673	chr20	82151183	82151371	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4462962	chr20	84869237	84869400	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4462963	chr20	84869398	84869509	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4462964	chr20	84869507	84869615	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4462965	chr20	84869613	84869724	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4462966	chr20	84869722	84869833	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4462967	chr20	84869831	84869939	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4462968	chr20	84869937	84870048	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4462969	chr20	84870046	84870157	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4462970	chr20	84870155	84870266	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4462971	chr20	84870263	84870589	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4464555	chr20	85671219	85671379	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4464556	chr20	85671609	85671829	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4464605	chr20	85691861	85692242	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4465783	chr20	86484390	86484785	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4470199	chrX	1034753	1034797	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4470201	chrX	1035113	1035511	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4472598	chrX	2185353	2185482	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4473714	chrX	2748887	2748940	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4473716	chrX	2749222	2749618	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4474203	chrX	2977633	2978081	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4475786	chrX	3805402	3805769	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4477377	chrX	4701450	4701674	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4477379	chrX	4701987	4702199	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4478238	chrX	5230242	5230684	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4478986	chrX	5711398	5711844	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4480271	chrX	6511858	6512292	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4480610	chrX	6723349	6723772	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4483653	chrX	8517742	8518201	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4485154	chrX	9506054	9506398	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4485940	chrX	9996639	9996777	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4487106	chrX	10678495	10678845	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4487110	chrX	10679135	10679230	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4487439	chrX	10859575	10859990	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4488574	chrX	11534300	11534680	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4489172	chrX	11846735	11846963	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4490479	chrX	12696043	12696255	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4490481	chrX	12696559	12696724	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4490614	chrX	12770245	12770281	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4490616	chrX	12770584	12770989	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4494511	chrX	14831001	14831410	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4495428	chrX	15363358	15363824	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4495826	chrX	15633154	15633573	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4496842	chrX	16144881	16145234	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4496845	chrX	16145669	16145772	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4501394	chrX	18494599	18494989	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4510475	chrX	23738577	23738998	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4514481	chrX	26173301	26173690	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4519248	chrX	28981636	28982046	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4520813	chrX	29995711	29996011	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4520815	chrX	29996100	29996232	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4522343	chrX	30985749	30986053	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4522345	chrX	30986785	30986882	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4524681	chrX	32517935	32518348	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4525173	chrX	32827574	32827719	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4526347	chrX	33611595	33611947	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4529689	chrX	35719906	35719951	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4529691	chrX	35720250	35720568	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4530576	chrX	36288157	36288593	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4534969	chrX	38614685	38615141	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4534973	chrX	38617177	38617584	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4535653	chrX	38904661	38904702	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4536350	chrX	39221475	39221557	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4536352	chrX	39221856	39222083	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4536356	chrX	39222303	39222345	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4536520	chrX	39282207	39282300	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4539089	chrX	40759160	40759278	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4543527	chrX	43052349	43052429	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4544404	chrX	43640652	43641070	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4548409	chrX	45491907	45492026	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4548490	chrX	45526303	45526422	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4548758	chrX	45649071	45649278	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4548760	chrX	45649587	45649797	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4548889	chrX	45706521	45706812	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4550433	chrX	46387470	46387802	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4550437	chrX	46388104	46388166	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4550784	chrX	46513107	46513329	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4552466	chrX	47270491	47270904	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4552756	chrX	47418427	47418835	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4555360	chrX	48939475	48939891	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4555429	chrX	48974830	48975253	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4555782	chrX	49199481	49199802	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4556366	chrX	49593537	49593954	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4560228	chrX	52414062	52414133	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4564700	chrX	55358772	55359171	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4565778	chrX	56331918	56332274	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4565785	chrX	56335248	56335524	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4565787	chrX	56335555	56335696	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4566551	chrX	62048651	62049017	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4566948	chrX	62371986	62372394	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4567620	chrX	62799227	62799344	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4580002	chrX	70317757	70318045	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4581452	chrX	71071715	71071947	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4582285	chrX	71446446	71446813	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4582576	chrX	71604738	71605072	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4582959	chrX	72083033	72083323	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4583052	chrX	72173973	72174336	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4585765	chrX	73997572	73997968	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4587002	chrX	74979749	74980189	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4587206	chrX	75190828	75191150	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4589596	chrX	76792321	76792671	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4589613	chrX	76802686	76803066	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4590915	chrX	77877210	77877636	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4591420	chrX	78297490	78297663	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4591422	chrX	78297708	78297955	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4592844	chrX	79391226	79391621	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4593133	chrX	79568753	79569004	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4602578	chrX	86403930	86404349	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4602705	chrX	86472736	86473134	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4607902	chrX	89808611	89808977	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4610347	chrX	91540652	91541076	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4610743	chrX	91793230	91793655	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4610968	chrX	91952400	91952822	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4611238	chrX	92140110	92140558	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4612647	chrX	92959838	92960259	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4612653	chrX	92961972	92962399	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4615765	chrX	95019788	95020117	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4615767	chrX	95020414	95020510	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4615913	chrX	95113241	95113616	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4615915	chrX	95113922	95113981	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4618811	chrX	96920027	96920428	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4621828	chrX	99154246	99154290	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4623371	chrX	99940961	99941329	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4626305	chrX	101994635	101994702	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4629784	chrX	104151381	104151783	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4630164	chrX	104417581	104417680	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4630812	chrX	104904334	104904569	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4635235	chrX	107536567	107536757	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4635237	chrX	107537098	107537278	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4639097	chrX	110017784	110018183	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4643301	chrX	112472086	112472164	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4644083	chrX	112858245	112858657	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4646423	chrX	114160541	114160588	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4646425	chrX	114160888	114160934	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4647155	chrX	114718105	114718182	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4647157	chrX	114718469	114718829	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4653665	chrX	118431068	118431492	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4654207	chrX	118710496	118710630	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4654752	chrX	118975126	118975174	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4654756	chrX	118975709	118976023	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4654759	chrX	118976291	118976336	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4657894	chrX	121122824	121123214	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4658786	chrX	121733939	121734274	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4658790	chrX	121734572	121734667	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4660004	chrX	122259096	122259510	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4660765	chrX	122676893	122676980	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4660769	chrX	122678103	122678393	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4665000	chrX	125569937	125570300	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4666789	chrX	126872850	126873280	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4668391	chrX	127873747	127874107	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4669821	chrX	128562760	128562847	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4670535	chrX	128921979	128922252	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4670537	chrX	128922544	128922594	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4676376	chrX	132431056	132431340	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4676635	chrX	132556108	132556200	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4678973	chrX	133747837	133748026	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4678976	chrX	133748377	133748598	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4681156	chrX	134937122	134937390	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4681158	chrX	134937682	134937722	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4683629	chrX	136261592	136261842	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4684879	chrX	137098358	137098638	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4686325	chrX	138028211	138028273	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4686625	chrX	138244565	138244951	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4686743	chrX	138309531	138309808	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4688072	chrX	139038732	139039006	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4688422	chrX	139230403	139230615	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4688426	chrX	139231030	139231261	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4689235	chrX	139672278	139672753	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4689792	chrX	140015052	140015216	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4690004	chrX	140136833	140137199	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4690376	chrX	140380843	140380890	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4690380	chrX	140383033	140383426	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4690972	chrX	140748550	140748968	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4694844	chrX	143084524	143084957	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4699075	chrX	145590715	145591097	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4699496	chrX	145850120	145850538	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4701641	chrX	147412095	147412187	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4701642	chrX	147412185	147412280	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4701644	chrX	147412581	147412707	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4701834	chrX	147520696	147521044	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4703662	chrX	148769449	148769840	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4703713	chrX	148790873	148791225	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4703891	chrX	148909196	148909241	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4703894	chrX	148909594	148909900	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4703896	chrX	148910013	148910091	1	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4704144	chrX	149000248	149000665	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4704995	chrX	149424864	149425277	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4707597	chrX	151145463	151145499	0	LTR
MSTC|LTR|MaLR-HOMER4707599	chrX	151146058	151146447	0	LTR
